RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482651.5

HDGF-208, Transcript of heparin binding growth factor, human

TSL 3

Gene HDGF, Length 966 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDGF-208	ENST00000482651	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
HDGF-208	ENST00000482651	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		7.4	□□□□□ -1.22
HDGF-208	ENST00000482651	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		7.4	□□□□□ -1.22
HDGF-208	ENST00000482651	STARD10	Q9Y365	291 aa		7.4	□□□□□ -1.22
HDGF-208	ENST00000482651	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		7.4	□□□□□ -1.22
HDGF-208	ENST00000482651	CACNG2	Q9Y698	323 aa		7.4	□□□□□ -1.22
HDGF-208	ENST00000482651	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651		A0A1B0GVI7	797 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	GGT3P	A6NGU5	568 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	TMEM212	A6NML5	194 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	RNF212B	A8MTL3	300 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	FAM157A	C9JC47	383 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651		G3V3Q6	166 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	UBE2C	O00762	179 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	DHFR	P00374	187 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	CLEC3B	P05452	202 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	MSMB	P08118	114 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	ANXA3	P12429	323 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	CTRB1	P17538	263 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	OR12D2	P58182	307 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	IL13RA1	P78552	427 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	DHODH	Q02127	395 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	SLC3A1	Q07837	685 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	MADCAM1	Q13477	382 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	TP53I3	Q53FA7	332 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	AVPI1	Q5T686	147 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	OR51F2	Q8NH61	342 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	CCL17	Q92583	94 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	THRSP	Q92748	146 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	RAB1C	Q92928	201 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	TMEM186	Q96B77	213 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	HAVCR1	Q96D42	359 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	CMBL	Q96DG6	245 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	TIMD4	Q96H15	378 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	REEP6	Q96HR9	211 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	OR51J1	Q9H342	316 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	MSL2	Q9HCI7	577 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	PRELID1	Q9Y255	219 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	ATR	Q13535	2644 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		7.38	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		7.38	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		7.38	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	MPC2	O95563	127 aa		7.38	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	IGHV2-5	P01817	119 aa		7.38	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	RRAS	P10301	218 aa		7.38	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	SLC2A1	P11166	492 aa		7.38	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	ARL3	P36405	182 aa		7.38	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	PITPNB	P48739	271 aa		7.38	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	INPP1	P49441	399 aa		7.38	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	GRK1	Q15835	563 aa		7.38	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651		Q6ZR03	302 aa		7.38	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	DOK3	Q7L591	496 aa		7.38	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	SSX6	Q7RTT6	188 aa		7.38	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	COMMD7	Q86VX2	200 aa		7.38	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	TPRA1	Q86W33	373 aa		7.38	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		7.38	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		7.38	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		7.38	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		7.38	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	RAB39B	Q96DA2	213 aa		7.38	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	PELI1	Q96FA3	418 aa		7.38	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	TMED9	Q9BVK6	235 aa		7.38	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		7.38	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		7.38	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		7.38	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	TMEM140	Q9NV12	185 aa		7.38	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	MED9	Q9NWA0	146 aa		7.38	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	FAM206A	Q9NX38	181 aa		7.38	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	COPZ2	Q9P299	210 aa		7.38	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23

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