RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481641.1

CLK1-211, Transcript of CDC like kinase 1, humanhuman

TSL 4

Gene CLK1, Length 690 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1-211ENST00000481641 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 SLC34A1Q06495 639 aa14.94□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 MEDAGQ5VYS4 303 aa14.94□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa14.94□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 NDNFQ8TB73 568 aa14.94□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 OR5M11Q96RB7 305 aa14.94□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 CDCA4Q9BXL8 241 aa14.94□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 TMEM133Q9H2Q1 129 aa14.94□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 FAM172BPA6NC97 362 aa14.93□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 CD28P10747 220 aa14.93□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 GABRB1P18505 474 aa14.93□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 CCR9P51686 369 aa14.93□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 P2RX3P56373 397 aa14.93□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 BLCAPP62952 87 aa14.93□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 SCN1BQ07699 218 aa14.93□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa14.93□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa14.93□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 Q8N2B8 174 aa14.93□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 SPSB1Q96BD6 273 aa14.93□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 ALG8Q9BVK2 526 aa14.93□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 AMBNQ9NP70 447 aa14.93□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 ING3Q9NXR8 418 aa14.93□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 GLS2Q9UI32 602 aa14.93□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 MYRFQ9Y2G1 1151 aa14.93□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 GMPPBQ9Y5P6 360 aa14.93□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 PLXNB1O43157 2135 aa14.93□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 E9PI62 339 aa14.92□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 F2RL2O00254 374 aa14.92□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 SH2D1BO14796 132 aa14.92□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 KDM4BO94953 1096 aa14.92□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 GDNFP39905 211 aa14.92□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 GLIPR1P48060 266 aa14.92□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 AESQ08117 197 aa14.92□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 TMEM95Q3KNT9 176 aa14.92□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 SPIN3Q5JUX0 258 aa14.92□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 MINOS1Q5TGZ0 78 aa14.92□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 CLEC7AQ9BXN2 247 aa14.92□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 NEK6Q9HC98 313 aa14.92□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa14.92□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 FBXO24O75426 580 aa14.91□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 OPN1MWP04001 364 aa14.91□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 OPN1MW2P0DN77 364 aa14.91□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 OPN1MW3P0DN78 364 aa14.91□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 DBTP11182 482 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 CD24P25063 80 aa14.91□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 ERP29P30040 261 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 GALEQ14376 348 aa14.91□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 Q6P435 159 aa14.91□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 OR4P4Q8NGL7 312 aa14.91□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 SLC29A1Q99808 456 aa14.91□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 ZNF649Q9BS31 505 aa14.91□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 PRSS22Q9GZN4 317 aa14.91□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa14.91□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 PITPNC1Q9UKF7 332 aa14.91□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 MT-ND2P03891 347 aa14.9□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 ZNF44P15621 663 aa14.9□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 CDK2P24941 298 aa14.9□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 DYNLT3P51808 116 aa14.9□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 UTF1Q5T230 341 aa14.9□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 ZFP1Q6P2D0 407 aa14.9□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 ABHD12Q8N2K0 398 aa14.9□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa14.9□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 COMMD4Q9H0A8 199 aa14.9□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 NOTCH3Q9UM47 2321 aa14.9□□□□□ -0.02
CLK1-211ENST00000481641 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa14.89□□□□□ -0.03
CLK1-211ENST00000481641 A0A0G2JK05 382 aa14.89□□□□□ -0.03
CLK1-211ENST00000481641 SNTNA6NMZ2 147 aa14.89□□□□□ -0.03
CLK1-211ENST00000481641 ZFPL1O95159 310 aa14.89□□□□□ -0.03
CLK1-211ENST00000481641 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CLK1-211ENST00000481641 HCKP08631 526 aa14.89□□□□□ -0.03
CLK1-211ENST00000481641 TMEM225BP0DP42 221 aa14.89□□□□□ -0.03
CLK1-211ENST00000481641 LMO1P25800 156 aa14.89□□□□□ -0.03
CLK1-211ENST00000481641 HTR1DP28221 377 aa14.89□□□□□ -0.03
CLK1-211ENST00000481641 ZP1P60852 638 aa14.89□□□□□ -0.03
CLK1-211ENST00000481641 IL18R1Q13478 541 aa14.89□□□□□ -0.03
CLK1-211ENST00000481641 BEAN1Q3B7T3 259 aa14.89□□□□□ -0.03
CLK1-211ENST00000481641 FBLN7Q53RD9 439 aa14.89□□□□□ -0.03
CLK1-211ENST00000481641 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CLK1-211ENST00000481641 LPCAT4Q643R3 524 aa14.89□□□□□ -0.03
CLK1-211ENST00000481641 DTX3Q8N9I9 347 aa14.89□□□□□ -0.03
CLK1-211ENST00000481641 RHOXF1Q8NHV9 184 aa14.89□□□□□ -0.03
CLK1-211ENST00000481641 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CLK1-211ENST00000481641 COQ2Q96H96 371 aa14.89□□□□□ -0.03
CLK1-211ENST00000481641 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CLK1-211ENST00000481641 MMP28Q9H239 520 aa14.89□□□□□ -0.03
CLK1-211ENST00000481641 ERVK13-1Q9NX77 482 aa14.89□□□□□ -0.03
CLK1-211ENST00000481641 FAM90A22PA8MWA6 464 aa14.88□□□□□ -0.03
CLK1-211ENST00000481641 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CLK1-211ENST00000481641 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CLK1-211ENST00000481641 KISS1Q15726 138 aa14.88□□□□□ -0.03
CLK1-211ENST00000481641 HEPN1Q6WQI6 88 aa14.88□□□□□ -0.03
CLK1-211ENST00000481641 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa14.88□□□□□ -0.03
CLK1-211ENST00000481641 CCDC121Q6ZUS5 278 aa14.88□□□□□ -0.03
CLK1-211ENST00000481641 SYS1Q8N2H4 156 aa14.88□□□□□ -0.03
CLK1-211ENST00000481641 OR52I1Q8NGK6 324 aa14.88□□□□□ -0.03
CLK1-211ENST00000481641 CORO2AQ92828 525 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.8 ms