RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480171.7

PKP4-210, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 2

Gene PKP4, Length 2,772 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-210ENST00000480171 GNMTQ14749 295 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 AWAT1Q58HT5 328 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 LFNGQ8NES3 379 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 NTNG2Q96CW9 530 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 REEP6Q96HR9 211 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 LHX6Q9UPM6 363 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 ABCA7Q8IZY2 2146 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 GJE1A6NN92 205 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 LCATP04180 440 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 SMIM6P0DI80 62 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 ZNF44P15621 663 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 UCP3P55916 312 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 SRPXP78539 464 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 SNAI3Q3KNW1 292 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 PHLDA2Q53GA4 152 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 LYZL2Q7Z4W2 148 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 C20orf196Q8IYI0 205 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 OSR2Q8N2R0 312 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 C18orf12Q96KH6 178 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 TCEAL7Q9BRU2 100 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 DUSP23Q9BVJ7 150 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 KCNJ16Q9NPI9 418 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 ZNF391Q9UJN7 358 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 SLC7A11Q9UPY5 501 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 TMED3Q9Y3Q3 217 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 IGHEP01854 428 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 ZNF806P0C7X5 589 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 STAG3L3P0CL85 134 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 LIFP15018 202 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 AKR1C3P42330 323 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 MALLQ13021 153 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 RHEBQ15382 184 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 ASCL4Q6XD76 172 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 OR5L1Q8NGL2 311 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 OR2AE1Q8NHA4 323 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 OR1F12Q8NHA8 337 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 AKR7LQ8NHP1 331 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 FBXO17Q96EF6 278 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 SLC2A9Q9NRM0 540 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 CFAP54Q96N23 3096 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 UMAD1C9J7I0 102 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 NDUFS8O00217 210 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 XRCC2O43543 280 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 NRASP01111 189 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 CD63P08962 238 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 CST2P09228 141 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 CRYGSP22914 178 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 ACKR3P25106 362 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 PMELP40967 661 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 CCL7P80098 99 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 OR8B8Q15620 311 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 EXT1Q16394 746 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 OXLD1Q5BKU9 147 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 GUSBP11Q6P575 273 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 CLEC9AQ6UXN8 241 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 ETV3LQ6ZN32 361 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 OR52M1Q8NGK5 317 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 OR1J1Q8NGS3 322 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 SLC35B3Q9H1N7 401 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 LIME1Q9H400 295 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 CEP192Q8TEP8 1941 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 C5orf52A6NGY3 159 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 DNPH1O43598 174 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 AGAP20933 346 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 SSR4P51571 173 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 FUT6P51993 359 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 PRRX1P54821 245 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 RAB1AP62820 205 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP7.54□□□□□ -1.27e-7■■□□□ 14
PKP4-210ENST00000480171 PCOLCEQ15113 449 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 DTX1Q86Y01 620 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 FAM185AQ8N0U4 392 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 GPR137CQ8N3F9 429 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 CD300LFQ8TDQ1 290 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 MOB3AQ96BX8 217 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 GNRHR2Q96P88 292 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 SPXQ9BT56 116 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 SMDT1Q9H4I9 107 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 WDR54Q9H977 334 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 WFDC1Q9HC57 220 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 IL36GQ9NZH8 169 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-210ENST00000480171 MSTNO14793 375 aa7.54□□□□□ -1.2
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