RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474409.1

CNN3-205, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 3

Gene CNN3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-205ENST00000474409 A0A0A6YYD4 124 aa6.98□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 A0A0A6YYH2 397 aa6.98□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 A6NJ64 397 aa6.98□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 H3BUI4 141 aa6.98□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 DEGS1O15121 323 aa6.98□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 TMPRSS2O15393 492 aa6.98□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 SOCS1O15524 211 aa6.98□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 PDCD6O75340 191 aa6.98□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 OR2H2O95918 312 aa6.98□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 IGHV2-70P01814 119 aa6.98□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 TFF1P04155 84 aa6.98□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 RPS2P15880 293 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 MNDAP41218 407 aa6.98□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 TMEM33P57088 247 aa6.98□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 TAS2R20P59543 309 aa6.98□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 COL10A1Q03692 680 aa6.98□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 IL18Q14116 193 aa6.98□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 PDCD1Q15116 288 aa6.98□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 MOGAT2Q3SYC2 334 aa6.98□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 FAM131AQ6UXB0 335 aa6.98□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 DCDC5Q6ZRR9 648 aa6.98□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa6.98□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 SPICQ8N5J4 248 aa6.98□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 DTX3Q8N9I9 347 aa6.98□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 TMEM185AQ8NFB2 350 aa6.98□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 OR4M1Q8NGD0 313 aa6.98□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 OR10R2Q8NGX6 335 aa6.98□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 PPP1R35Q8TAP8 253 aa6.98□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 RAB3CQ96E17 227 aa6.98□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa6.98□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 BPESC1Q9GZL8 116 aa6.98□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 PPA2Q9H2U2 334 aa6.98□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 NARFLQ9H6Q4 476 aa6.98□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 ZNF665Q9H7R5 613 aa6.98□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 PCDHB10Q9UN67 800 aa6.98□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa6.98□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 CENPEQ02224 2701 aa6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 CSMD2Q7Z408 3487 aa6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 TRAV18A0A075B6X5 111 aa6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 TMEM235A6NFC5 223 aa6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 MCRIP1C9JLW8 97 aa6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 RAB27BO00194 218 aa6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 NDUFS8O00217 210 aa6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 ADAM20O43506 726 aa6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 XRCC3O43542 346 aa6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 CHATP28329 748 aa6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 PRDX2P32119 198 aa6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 TNFSF8P32971 234 aa6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 NR4A2P43354 598 aa6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 GNG2P59768 71 aa6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 IL13RA1P78552 427 aa6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 ARL6IP1Q15041 203 aa6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 TMEM155Q4W5P6 130 aa6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 Q5PR19 223 aa6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 ZNF788Q6ZQV5 615 aa6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 Q6ZTK2 550 aa6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 NLRC3Q7RTR2 1065 aa6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 C6orf201Q7Z4U5 140 aa6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 BIVMQ86UB2 503 aa6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 SNX29P2Q8IUI4 249 aa6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 ZNF561Q8N587 486 aa6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 FAM89BQ8N5H3 189 aa6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 CD177Q8N6Q3 437 aa6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 FAM216BQ8N7L0 139 aa6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 SUMF2Q8NBJ7 301 aa6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 ANGPTL6Q8NI99 470 aa6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 S100ZQ8WXG8 99 aa6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 MBD6Q96DN6 1003 aa6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 POM121Q96HA1 1249 aa6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 GAFA1Q96PS6 74 aa6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 TSC22D3Q99576 134 aa6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 CCL13Q99616 98 aa6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 TMEM246Q9BRR3 403 aa6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 CHST6Q9GZX3 395 aa6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 DNTTIP1Q9H147 329 aa6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 IFT22Q9H7X7 185 aa6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 ZNF581Q9P0T4 197 aa6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 BAHCC1Q9P281 2608 aa6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 METRNQ9UJH8 293 aa6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 ZNF222Q9UK12 451 aa6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 POLQO75417 2590 aa6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 FBN2P35556 2912 aa6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 CELSR2Q9HCU4 2923 aa6.97□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 HECTD1Q9ULT8 2610 aa6.96□□□□□ -1.3
CNN3-205ENST00000474409 TRAV24A0A0B4J272 114 aa6.96□□□□□ -1.3
CNN3-205ENST00000474409 A0A1B0GW55 424 aa6.96□□□□□ -1.3
CNN3-205ENST00000474409 UBE2QL1A1L167 161 aa6.96□□□□□ -1.3
CNN3-205ENST00000474409 FABP12A6NFH5 140 aa6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms