RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		14.61	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		14.6	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	TMEM82	A0PJX8	343 aa		14.6	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	14.6	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		14.6	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	ZNF737	O75373	536 aa		14.6	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	GPX5	O75715	221 aa		14.6	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	OR2H2	O95918	312 aa		14.6	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	14.6	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	MTNR1B	P49286	362 aa		14.6	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	BMX	P51813	675 aa		14.6	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	GPR50	Q13585	617 aa		14.6	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		14.6	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		14.6	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		14.6	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	OR8H2	Q8N162	312 aa		14.6	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		14.6	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		14.6	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		14.6	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	MGLL	Q99685	303 aa		14.6	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	METTL9	Q9H1A3	318 aa		14.6	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		14.6	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	14.6	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902		A0A0A6YYJ9	748 aa		14.59	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	DEGS1	O15121	323 aa		14.59	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	PIN1P1	O15428	100 aa		14.59	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	VENTX	O95231	258 aa		14.59	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	DLX1	P56177	255 aa		14.59	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	GABARAPL2	P60520	117 aa		14.59	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	14.59	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	14.59	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		14.59	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		14.59	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		14.59	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	MUL1	Q969V5	352 aa		14.59	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	JMJD8	Q96S16	334 aa		14.59	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		14.59	□□□□□ -0.07
USP19-210	ENST00000465902	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		14.58	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902		A0A1W2PRD5	423 aa		14.58	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902		A0A1W2PRF3	423 aa		14.58	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902		A0A1W2PRM7	423 aa		14.58	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902		M0R1W7	72 aa		14.58	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	14.58	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	PSPN	O60542	156 aa		14.58	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	IGHV1-69	P01742	117 aa		14.58	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	CPE	P16870	476 aa		14.58	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	SERPINA2	P20848	420 aa		14.58	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	14.58	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	TPBG	Q13641	420 aa		14.58	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		14.58	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		14.58	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		14.58	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	SVOP	Q8N4V2	548 aa		14.58	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902		Q8N7P7	452 aa		14.58	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		14.58	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		14.58	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	14.58	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	PPA2	Q9H2U2	334 aa		14.58	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	14.58	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	14.58	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		14.58	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	ING3	Q9NXR8	418 aa		14.58	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	14.58	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		14.57	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902		A0A1W2PPE2	198 aa		14.57	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902		A0A1W2PR64	198 aa		14.57	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902		A0A1W2PRV1	198 aa		14.57	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	HSPB6	O14558	160 aa		14.57	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	MGST3	O14880	152 aa		14.57	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	CCL3L1	P16619	93 aa		14.57	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	OR3A1	P47881	315 aa		14.57	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	BPIFB3	P59826	476 aa		14.57	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	HILS1	P60008	231 aa		14.57	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	14.57	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	KLRD1	Q13241	179 aa		14.57	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	TRAM1	Q15629	374 aa		14.57	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	PIGY	Q3MUY2	71 aa		14.57	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		14.57	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	ELP2	Q6IA86	826 aa		14.57	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		14.57	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		14.57	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	USP43	Q70EL4	1123 aa		14.57	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		14.57	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	SLITRK2	Q9H156	845 aa		14.57	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		14.57	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902		A0A0G2JK05	382 aa		14.56	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		14.56	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	MEGF11	A6BM72	1044 aa		14.56	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	14.56	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	14.56	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	GUCA2A	Q02747	115 aa		14.56	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	BAMBI	Q13145	260 aa		14.56	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	ZNF273	Q14593	569 aa		14.56	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		14.56	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	AWAT2	Q6E213	333 aa		14.56	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902		Q6P435	159 aa		14.56	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		14.56	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	ASCL4	Q6XD76	172 aa		14.56	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		14.56	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		14.56	□□□□□ -0.08

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