RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412640.6

SOX9-AS1-201, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 635 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C11orf91Q3C1V1 193 aa8.01□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CEACAM21Q3KPI0 293 aa8.01□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MOGAT2Q3SYC2 334 aa8.01□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PLET1Q6UQ28 207 aa8.01□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa8.01□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C1QL2Q7Z5L3 287 aa8.01□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SAXO1Q8IYX7 474 aa8.01□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FTMTQ8N4E7 242 aa8.01□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM104Q8NE00 496 aa8.01□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR56B2PQ8NGI1 322 aa8.01□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR56B1Q8NGI3 324 aa8.01□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR10R2Q8NGX6 335 aa8.01□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa8.01□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BORCS8Q96FH0 119 aa8.01□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM59Q9BXS4 323 aa8.01□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 POFUT1Q9H488 388 aa8.01□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NARFLQ9H6Q4 476 aa8.01□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HRASLSQ9HDD0 168 aa8.01□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PTTG3PQ9NZH4 202 aa8.01□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NLKQ9UBE8 527 aa8.01□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ANAPC10Q9UM13 185 aa8.01□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC7A11Q9UPY5 501 aa8.01□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MPC1Q9Y5U8 109 aa8.01□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC25A15Q9Y619 301 aa8.01□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PQLC2LA1A4F0 135 aa8□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CD300LBA8K4G0 201 aa8□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LYNX1G3V0Z9 82 aa8□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 M0QZ24 198 aa8□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 AKR7A2O43488 359 aa8□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MSMBP08118 114 aa8□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CELA3BP08861 270 aa8□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CSF1P09603 554 aa8□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRAPPC2P0DI81 140 aa8□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRAPPC2BP0DI82 140 aa8□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LYNX1P0DP58 116 aa8□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PTHLHP12272 177 aa8□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RAC2P15153 192 aa8□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRTN3P24158 256 aa8□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 UCP2P55851 309 aa8□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM50BP56557 158 aa8□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ACTBP60709 375 aa8□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PDZK1IP1Q13113 114 aa8□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ARL6IP1Q15041 203 aa8□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa8□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PLCXD3Q63HM9 321 aa8□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C11orf87Q6NUJ2 197 aa8□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa8□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MOB3CQ70IA8 216 aa8□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF554Q86TJ5 538 aa8□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa8□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM229BQ8NBD8 167 aa8□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR5A2Q8NGI9 324 aa8□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MRAPQ8TCY5 172 aa8□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NPRL2Q8WTW4 380 aa8□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PIGCQ92535 297 aa8□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 UPRTQ96BW1 309 aa8□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 METTL9Q9H1A3 318 aa8□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MMP28Q9H239 520 aa8□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DPAGT1Q9H3H5 408 aa8□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CDH20Q9HBT6 801 aa8□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ING4Q9UNL4 249 aa8□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa8□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa7.99□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF850A8MQ14 1090 aa7.99□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 G3V4G9 280 aa7.99□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MFNGO00587 321 aa7.99□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MPIG6BO95866 241 aa7.99□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CD74P04233 296 aa7.99□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TCRBP04435 133 aa7.99□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MGMTP16455 207 aa7.99□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SELEP16581 610 aa7.99□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NAT1P18440 290 aa7.99□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CPT2P23786 658 aa7.99□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HLA-DMAP28067 261 aa7.99□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RCVRNP35243 200 aa7.99□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAUP35544 74 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 VEGFCP49767 419 aa7.99□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PPP1CBP62140 327 aa7.99□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GUCA2AQ02747 115 aa7.99□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRDX4Q13162 271 aa7.99□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BEAN1Q3B7T3 259 aa7.99□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CDNFQ49AH0 187 aa7.99□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC22A6Q4U2R8 563 aa7.99□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 Q6ZTK2 550 aa7.99□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BTN2A1Q7KYR7 527 aa7.99□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa7.99□□□□□ -1.13
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms