RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 TSPO2Q5TGU0 170 aa20.52■□□□□ 0.88
PMS1-205ENST00000409985 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PMS1-205ENST00000409985 FAM185AQ8N0U4 392 aa20.52■□□□□ 0.88
PMS1-205ENST00000409985 OR2M7Q8NG81 312 aa20.52■□□□□ 0.88
PMS1-205ENST00000409985 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PMS1-205ENST00000409985 RSRP1Q9BUV0 290 aa20.52■□□□□ 0.88
PMS1-205ENST00000409985 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PMS1-205ENST00000409985 SEC11CQ9BY50 192 aa20.52■□□□□ 0.88
PMS1-205ENST00000409985 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PMS1-205ENST00000409985 NSG2Q9Y328 171 aa20.52■□□□□ 0.88
PMS1-205ENST00000409985 STARD10Q9Y365 291 aa20.52■□□□□ 0.88
PMS1-205ENST00000409985 C21orf140B9A014 251 aa20.52■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 H2AFB1P0C5Y9 115 aa20.52■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 OPRM1P35372 400 aa20.52■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 LHX2P50458 406 aa20.52■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 PIGYQ3MUY2 71 aa20.52■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 LIAT1Q6ZQX7 453 aa20.52■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 CLRN3Q8NCR9 226 aa20.52■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 PIGCQ92535 297 aa20.52■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 C18orf12Q96KH6 178 aa20.52■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 ABI3Q9P2A4 366 aa20.52■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 ZNF724A8MTY0 619 aa20.51■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 TMEM164Q5U3C3 297 aa20.51■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 GPR157Q5UAW9 335 aa20.51■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 IGF2-ASQ6U949 168 aa20.51■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 LGI3Q8N145 548 aa20.51■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 UBAC2Q8NBM4 344 aa20.51■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 AIFM2Q9BRQ8 373 aa20.51■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 ARV1Q9H2C2 271 aa20.51■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 OPA3Q9H6K4 179 aa20.51■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 PQLC2LA1A4F0 135 aa20.5■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 NEURL1O76050 574 aa20.5■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 FCGR2CP31995 323 aa20.5■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 CAV2P51636 162 aa20.5■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 SRPXP78539 464 aa20.5■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 SLC22A25Q6T423 547 aa20.5■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 PARP11Q9NR21 331 aa20.5■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 PCSK5Q92824 1860 aa20.5■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 PLATP00750 562 aa20.5■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 TGIF1Q15583 401 aa20.5■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 ABHD17BQ5VST6 288 aa20.5■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 OR4A4PQ8NGN8 299 aa20.5■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 SLC2A9Q9NRM0 540 aa20.5■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 AMDHD2Q9Y303 409 aa20.5■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 CLDN18P56856 261 aa20.49■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 ARF1P84077 181 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 IL13RA2Q14627 380 aa20.49■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 ZNF611Q8N823 705 aa20.49■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 OR2S2Q9NQN1 319 aa20.49■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 TMED3Q9Y3Q3 217 aa20.49■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 SYNGR4O95473 234 aa20.48■□□□□ 0.87
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PMS1-205ENST00000409985 LYPD6BQ8NI32 183 aa20.48■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 TOMM40LQ969M1 308 aa20.48■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 MICU1Q9BPX6 476 aa20.48■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 SLC7A10Q9NS82 523 aa20.48■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 UQCC1Q9NVA1 299 aa20.48■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 ZNF587BE7ETH6 402 aa20.47■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 GLAP06280 429 aa20.47■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 SPINK14Q6IE38 97 aa20.47■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 ZNF581Q9P0T4 197 aa20.47■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 ARR3P36575 388 aa20.47■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 TMEM33P57088 247 aa20.47■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 HERV-K104P61576 105 aa20.47■□□□□ 0.87
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PMS1-205ENST00000409985 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
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PMS1-205ENST00000409985 SNAPINO95295 136 aa20.46■□□□□ 0.87
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PMS1-205ENST00000409985 RND3P61587 244 aa20.46■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 CEACAM21Q3KPI0 293 aa20.46■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 OR2A2Q6IF42 318 aa20.46■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 SLC25A26Q70HW3 274 aa20.46■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 GLYATL2Q8WU03 294 aa20.46■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 ZNF442Q9H7R0 627 aa20.46■□□□□ 0.87
PMS1-205ENST00000409985 RHOFQ9HBH0 211 aa20.46■□□□□ 0.87
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