RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 NDUFB7P17568 137 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 DRD1P21728 446 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 CD38P28907 300 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 CLDN15P56746 228 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 ZNF117Q03924 483 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 C17orf99Q6UX52 265 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 OR4B1Q8NGF8 309 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 PLPPR2Q96GM1 343 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 OR2A5Q96R48 311 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 UQCR10Q9UDW1 63 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 FRG2CA6NGY1 282 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 C4orf47A7E2U8 309 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 PRRT4C9JH25 899 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 DHRS3O75911 302 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 VSIG8P0DPA2 414 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 HOXA6P31267 233 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 TBC1D28Q2M2D7 210 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 SLC35E3Q7Z769 313 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 ZNF683Q8IZ20 524 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 ASB5Q8WWX0 329 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 OR6C1Q96RD1 312 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 COMMD5Q9GZQ3 224 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 NHSL1Q5SYE7 1610 aa8.67□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 IFITM10A6NMD0 228 aa8.67□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 FAM87AP0C7U9 286 aa8.67□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 CHRNB4P30926 498 aa8.67□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 MDH2P40926 338 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 MESTQ5EB52 335 aa8.67□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 TRAT1Q6PIZ9 186 aa8.67□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 NT5CQ8TCD5 201 aa8.67□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 SLC2A8Q9NY64 477 aa8.67□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 A0A1B0GX78 115 aa8.67□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 PDCD6O75340 191 aa8.67□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 CLEC3BP05452 202 aa8.67□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 BRS3P32247 399 aa8.67□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 COMPP49747 757 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 PRSS12P56730 875 aa8.67□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 PLP1P60201 277 aa8.67□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 RHOBP62745 196 aa8.67□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 GALMQ96C23 342 aa8.67□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa8.67□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 SLC45A2Q9UMX9 530 aa8.67□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 DOT1LQ8TEK3 1739 aa8.67□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 UQCRFS1P47985 274 aa8.67□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 SCCPDHQ8NBX0 429 aa8.67□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 OR11L1Q8NGX0 322 aa8.67□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa8.67□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 A6NCN8 305 aa8.66□□□□□ -1.02
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HERC3-202ENST00000402738 VDAC1P21796 283 aa8.66□□□□□ -1.02
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HERC3-202ENST00000402738 IL23AQ9NPF7 189 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 TRIP11Q15643 1979 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 HKR1P10072 659 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 CEACAM6P40199 344 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 CBLN3Q6UW01 205 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
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HERC3-202ENST00000402738 NRTNQ99748 197 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 OBP2AQ9NY56 170 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 OR51B4Q9Y5P0 310 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 ECM29Q5VYK3 1845 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 OR2M5A3KFT3 312 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 FHITP49789 147 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 METAP1P53582 386 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 TCTAP57738 103 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 GNB1P62873 340 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 MYBPHQ13203 477 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 COX19Q49B96 90 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
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HERC3-202ENST00000402738 MRGPRX4Q96LA9 322 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 PGLYRP3Q96LB9 341 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 DEDDO75618 318 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 SPNS3Q6ZMD2 512 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 PRSS41Q7RTY9 318 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 ZPLD1Q8TCW7 415 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 ZNF665Q9H7R5 613 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-202ENST00000402738 CACFD1Q9UGQ2 172 aa8.66□□□□□ -1.02
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