RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370287.7

CSAG1-202, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSAG1, Length 875 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-202ENST00000370287 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
CSAG1-202ENST00000370287 PIN1P1O15428 100 aa12.21□□□□□ -0.45
CSAG1-202ENST00000370287 MAGEB3O15480 346 aa12.21□□□□□ -0.45
CSAG1-202ENST00000370287 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
CSAG1-202ENST00000370287 ALDOBP05062 364 aa12.21□□□□□ -0.45
CSAG1-202ENST00000370287 CD1AP06126 327 aa12.21□□□□□ -0.45
CSAG1-202ENST00000370287 FSTP19883 344 aa12.21□□□□□ -0.45
CSAG1-202ENST00000370287 BDKRB2P30411 391 aa12.21□□□□□ -0.45
CSAG1-202ENST00000370287 HSPA13P48723 471 aa12.21□□□□□ -0.45
CSAG1-202ENST00000370287 DLX6P56179 175 aa12.21□□□□□ -0.45
CSAG1-202ENST00000370287 PPP3R1P63098 170 aa12.21□□□□□ -0.45
CSAG1-202ENST00000370287 ACTG1P63261 375 aa12.21□□□□□ -0.45
CSAG1-202ENST00000370287 BDH1Q02338 343 aa12.21□□□□□ -0.45
CSAG1-202ENST00000370287 BLMHQ13867 455 aa12.21□□□□□ -0.45
CSAG1-202ENST00000370287 INSL4Q14641 139 aa12.21□□□□□ -0.45
CSAG1-202ENST00000370287 GRK1Q15835 563 aa12.21□□□□□ -0.45
CSAG1-202ENST00000370287 Q6P435 159 aa12.21□□□□□ -0.45
CSAG1-202ENST00000370287 GDPD3Q7L5L3 318 aa12.21□□□□□ -0.45
CSAG1-202ENST00000370287 PXT1Q8NFP0 134 aa12.21□□□□□ -0.45
CSAG1-202ENST00000370287 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP12.21□□□□□ -0.45
CSAG1-202ENST00000370287 ZDHHC16Q969W1 377 aa12.21□□□□□ -0.45
CSAG1-202ENST00000370287 FAM192AQ9GZU8 254 aa12.21□□□□□ -0.45
CSAG1-202ENST00000370287 DUSP21Q9H596 190 aa12.21□□□□□ -0.45
CSAG1-202ENST00000370287 TMEM138Q9NPI0 162 aa12.21□□□□□ -0.45
CSAG1-202ENST00000370287 TPRKBQ9Y3C4 175 aa12.21□□□□□ -0.45
CSAG1-202ENST00000370287 GPX5O75715 221 aa12.2□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 CDRT1O95170 752 aa12.2□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 MELTFP08582 738 aa12.2□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 CRHBPP24387 322 aa12.2□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 VHLP40337 213 aa12.2□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 GUCA2AQ02747 115 aa12.2□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 ACSM1Q08AH1 577 aa12.2□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 Q6YL49 198 aa12.2□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 DERL3Q96Q80 235 aa12.2□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 TNFRSF19Q9NS68 423 aa12.2□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 RAB26Q9ULW5 256 aa12.2□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 DSCAML1Q8TD84 2053 aa12.2□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 SH2D1BO14796 132 aa12.19□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 NPFFO15130 113 aa12.19□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 RGS10O43665 173 aa12.19□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF44P15621 663 aa12.19□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 SAA4P35542 130 aa12.19□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 TGFBR2P37173 567 aa12.19□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 PTGFRP43088 359 aa12.19□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 MTNR1BP49286 362 aa12.19□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 UBE2E1P51965 193 aa12.19□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 SCN1BQ07699 218 aa12.19□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 SPHARQ15513 63 aa12.19□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 MED22Q15528 200 aa12.19□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 NCR3LG1Q68D85 454 aa12.19□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 ELP2Q6IA86 826 aa12.19□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 ASCL4Q6XD76 172 aa12.19□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 OR5D13Q8NGL4 314 aa12.19□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 C17orf50Q8WW18 174 aa12.19□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 PPA2Q9H2U2 334 aa12.19□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 RHOFQ9HBH0 211 aa12.19□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 NOX4Q9NPH5 578 aa12.19□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF581Q9P0T4 197 aa12.19□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 GLS2Q9UI32 602 aa12.19□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 A0A0G2JK05 382 aa12.18□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 A0A1W2PPH5 198 aa12.18□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 MEIOCA2RUB1 952 aa12.18□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 TMEM89A2RUT3 159 aa12.18□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 C17orf98A8MV24 154 aa12.18□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 CLDN34H7C241 214 aa12.18□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 MGST3O14880 152 aa12.18□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 HTR3BO95264 441 aa12.18□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 MAS1P04201 325 aa12.18□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 COX7A1P24310 79 aa12.18□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 LMO1P25800 156 aa12.18□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 MAP2K4P45985 399 aa12.18□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 BMXP51813 675 aa12.18□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 GP2P55259 537 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 RSU1Q15404 277 aa12.18□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 PIGYQ3MUY2 71 aa12.18□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 FAM27D1Q5T7N8 215 aa12.18□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 Q8NFD4 153 aa12.18□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 TBC1D15Q8TC07 691 aa12.18□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 TMED9Q9BVK6 235 aa12.18□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 CCDC90BQ9GZT6 254 aa12.18□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 CKLFQ9UBR5 152 aa12.18□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 ING4Q9UNL4 249 aa12.18□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 FOXJ3Q9UPW0 622 aa12.18□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 A0A1W2PP11 408 aa12.17□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 IGHV4-59P01825 116 aa12.17□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF728P0DKX0 622 aa12.17□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 ERP29P30040 261 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 GLIPR1P48060 266 aa12.17□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 P2RX3P56373 397 aa12.17□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 IL13RA2Q14627 380 aa12.17□□□□□ -0.46
CSAG1-202ENST00000370287 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms