RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 NXPH2O95156 264 aa12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF205O95201 554 aa12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 TFF1P04155 84 aa12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 IFNA6P05013 189 aa12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 FCGR3AP08637 254 aa12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 UQCRFS1P47985 274 aa12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 WDR82Q6UXN9 313 aa12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 C17orf107Q6ZR85 190 aa12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 SPERTQ8NA61 448 aa12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 OR5AP2Q8NGF4 316 aa12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 OR5H2Q8NGV7 314 aa12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 DMRTB1Q96MA1 342 aa12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 FN3KRPQ9HA64 309 aa12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF221Q9UK13 617 aa12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 VSIG4Q9Y279 399 aa12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa12.98□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 DEGS1O15121 323 aa12.98□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 OR3A3P47888 321 aa12.98□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 MPV17LQ2QL34 196 aa12.98□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 CHRFAM7AQ494W8 412 aa12.98□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 NUP37Q8NFH4 326 aa12.98□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa12.98□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 ELMOD3Q96FG2 381 aa12.98□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 POM121Q96HA1 1249 aa12.98□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 TLNRD1Q9H1K6 362 aa12.98□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 PLK3Q9H4B4 646 aa12.98□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 C1orf123Q9NWV4 160 aa12.98□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 ING3Q9NXR8 418 aa12.98□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 HCFC1P51610 2035 aa12.98□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 USP24Q9UPU5 2620 aa12.98□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 SIRPB1O00241 398 aa12.97□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF44P15621 663 aa12.97□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 PPP3CBP16298 524 aa12.97□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 MECP2P51608 486 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 TSPAN5P62079 268 aa12.97□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 RPS23P62266 143 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa12.97□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 VAX1Q5SQQ9 334 aa12.97□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 C20orf204Q6ZNR8 217 aa12.97□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 OVCH2Q7RTZ1 564 aa12.97□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 TMED4Q7Z7H5 227 aa12.97□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 PLPPR2Q96GM1 343 aa12.97□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 OR2V2Q96R30 315 aa12.97□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 PRRT1Q99946 306 aa12.97□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 MED28Q9H204 178 aa12.97□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 SLC2A8Q9NY64 477 aa12.97□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 EHFQ9NZC4 300 aa12.97□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 OR14J1Q9UGF5 321 aa12.97□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 ANXA10Q9UJ72 324 aa12.97□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 PKDREJQ9NTG1 2253 aa12.97□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa12.97□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 PLSCR5A0PG75 271 aa12.97□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM82A0PJX8 343 aa12.97□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 MCRIP1C9JLW8 97 aa12.97□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 PRSS44E7EML9 344 aa12.97□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 CXCL3P19876 107 aa12.97□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 TBPP20226 339 aa12.97□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 GNLYP22749 145 aa12.97□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 PMELP40967 661 aa12.97□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 IL13RA2Q14627 380 aa12.97□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 ADIPOQQ15848 244 aa12.97□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 NCMAPQ5T1S8 102 aa12.97□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 POC1AQ8NBT0 407 aa12.97□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 OR11H7Q8NGC8 314 aa12.97□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 MARCH1Q8TCQ1 289 aa12.97□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 NEK7Q8TDX7 302 aa12.97□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa12.97□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 LIME1Q9H400 295 aa12.97□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 A0A1B0GUH1 482 aa12.96□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 SHISA9B4DS77 424 aa12.96□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 OR2H2O95918 312 aa12.96□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 PLAUP00749 431 aa12.96□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 OR4A8P0C604 315 aa12.96□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 GSTT2P0CG29 244 aa12.96□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 TRAPPC2P0DI81 140 aa12.96□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 TRAPPC2BP0DI82 140 aa12.96□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 DTYMKP23919 212 aa12.96□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 CD200P41217 278 aa12.96□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 NPY4RP50391 375 aa12.96□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 Q8IYB0 196 aa12.96□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms