RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 ADRB1P08588 477 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 ASAH2BP0C7U1 165 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 FOXL2P58012 376 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 TSPO2Q5TGU0 170 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM251Q8N6I4 163 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 OR4S2Q8NH73 311 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 GPR27Q9NS67 375 aa14.36□□□□□ -0.11
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SH3BP4-201ENST00000344528 CRYBA1P05813 215 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 IGHV3-43DP0DP04 118 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 CXorf58Q96LI9 332 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 PRSS27Q9BQR3 290 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 MARVELD1Q9BSK0 173 aa14.35□□□□□ -0.11
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SH3BP4-201ENST00000344528 OOEPA6NGQ2 149 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 HAND1O96004 215 aa14.35□□□□□ -0.11
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SH3BP4-201ENST00000344528 SKA3Q8IX90 412 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 COMMD1Q8N668 190 aa14.35□□□□□ -0.11
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SH3BP4-201ENST00000344528 OR8B2Q96RD0 313 aa14.35□□□□□ -0.11
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SH3BP4-201ENST00000344528 GVQW1Q8N7I0 195 aa14.35□□□□□ -0.11
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SH3BP4-201ENST00000344528 LANCL1O43813 399 aa14.34□□□□□ -0.11
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SH3BP4-201ENST00000344528 P2RY6Q15077 328 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 PHYHD1Q5SRE7 291 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 GGNBP1Q5YKI7 109 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 TVP23CQ96ET8 276 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 STARD10Q9Y365 291 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 TGOLN2O43493 480 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 AGFG2O95081 481 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 OR51I2Q9H344 312 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 CCL21O00585 134 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 OR5AC1P0C628 307 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 OPRK1P41145 380 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 NDUFA6P56556 154 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC38A11Q08AI6 406 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 IL13RA2Q14627 380 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM214BQ7L5A3 538 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM231Q9H6L2 316 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 ONECUT2O95948 504 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 GGTLC2Q14390 218 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 C1orf185Q5T7R7 199 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 SOCS1O15524 211 aa14.33□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 SMIM10L1P0DMW3 83 aa14.33□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP14.33□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.11
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SH3BP4-201ENST00000344528 RPS4Y2Q8TD47 263 aa14.33□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 SMIM10Q96HG1 83 aa14.33□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A1W2PQM1 296 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 CELA2AP08217 269 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 BRS3P32247 399 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 SSTP61278 116 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
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SH3BP4-201ENST00000344528 B3GALNT1O75752 331 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ETV3LQ6ZN32 361 aa14.33□□□□□ -0.12
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SH3BP4-201ENST00000344528 OR13D1Q8NGV5 346 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 LRFN3Q9BTN0 628 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF665Q9H7R5 613 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 NKX2-8O15522 239 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 TXNDC12O95881 172 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 CTRB1P17538 263 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 RAB32Q13637 225 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 Q56UQ5 140 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 CTRB2Q6GPI1 263 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 UPK3AO75631 287 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 RBP4P02753 201 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 TLE1Q04724 770 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 NCR3LG1Q68D85 454 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 OR2C3Q8N628 320 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC35D1Q9NTN3 355 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ICE1Q9Y2F5 2266 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa14.32□□□□□ -0.12
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