RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 FAM221AA4D161 298 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXD8-201ENST00000313173 ECI1P42126 302 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXD8-201ENST00000313173 DHODHQ02127 395 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXD8-201ENST00000313173 IL13RA2Q14627 380 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM128Q5BJH2 165 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXD8-201ENST00000313173 DOLPP1Q86YN1 238 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXD8-201ENST00000313173 C1orf174Q8IYL3 243 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXD8-201ENST00000313173 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
HOXD8-201ENST00000313173 S100PBPQ96BU1 408 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXD8-201ENST00000313173 VAMP1P23763 118 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD8-201ENST00000313173 IKZF1Q13422 519 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD8-201ENST00000313173 IGFBP7Q16270 282 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD8-201ENST00000313173 LPCAT3Q6P1A2 487 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD8-201ENST00000313173 FAM58AQ8N1B3 248 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM230Q96A57 120 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD8-201ENST00000313173 PHB2Q99623 299 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD8-201ENST00000313173 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
HOXD8-201ENST00000313173 RHBDL1O75783 438 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXD8-201ENST00000313173 RGS11O94810 467 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXD8-201ENST00000313173 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
HOXD8-201ENST00000313173 OR5H8P0DN80 308 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXD8-201ENST00000313173 KITLGP21583 273 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXD8-201ENST00000313173 OR8G1Q15617 311 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXD8-201ENST00000313173 LY6G6FQ5SQ64 297 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXD8-201ENST00000313173 GFRALQ6UXV0 394 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXD8-201ENST00000313173 OR8G5Q8NG78 346 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXD8-201ENST00000313173 OR5M8Q8NGP6 311 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXD8-201ENST00000313173 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
HOXD8-201ENST00000313173 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM210A6NLX4 147 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
HOXD8-201ENST00000313173 SLC22A25Q6T423 547 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXD8-201ENST00000313173 Q6ZPA2 131 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXD8-201ENST00000313173 SCCPDHQ8NBX0 429 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
HOXD8-201ENST00000313173 SPACA1Q9HBV2 294 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM100Q9NV29 134 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXD8-201ENST00000313173 PPP3CBP16298 524 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXD8-201ENST00000313173 NAAAQ02083 359 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXD8-201ENST00000313173 BAMBIQ13145 260 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXD8-201ENST00000313173 C3orf36Q3SXR2 165 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF718Q3SXZ3 478 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXD8-201ENST00000313173 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXD8-201ENST00000313173 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 CASTOR1Q8WTX7 329 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 DSPP15924 2871 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 HLA-GP17693 338 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF154Q13106 437 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 Q8IYB0 196 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 PIGMQ9H3S5 423 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 DECR2Q9NUI1 292 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF835Q9Y2P0 537 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 PRR14LQ5THK1 2151 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 A8MXE2 369 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 MCRIP1C9JLW8 97 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 PGAM2P15259 253 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 PI3P19957 117 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 DUSP1P28562 367 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 GCH1P30793 250 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF83P51522 516 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP22.81■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 LIN54Q6MZP7 749 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 DHRS11Q6UWP2 260 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 Q6ZS49 121 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 IFT22Q9H7X7 185 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 TINAGQ9UJW2 476 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 H0YL77 283 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 SFT2D2O95562 160 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 NAPSAO96009 420 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 MUCL1Q96DR8 90 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 PLSCR5A0PG75 271 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 MLNRO43193 412 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 GLAP06280 429 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 BMP5P22003 454 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 ERVK11-1P61568 191 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 SUMF2Q8NBJ7 301 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 DHRS9Q9BPW9 319 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 GLRA1P23415 457 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 NEK7Q8TDX7 302 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 NRIP2Q9BQI9 281 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 LIME1Q9H400 295 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 A0A0G2JNJ9 132 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 M0R1B8 84 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 PGA5P0DJD9 388 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 FABP6P51161 128 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 C6orf183Q5T699 404 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 WDR13Q9H1Z4 485 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 CXXC4Q9H2H0 198 aa22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms