RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 HMX3A6NHT5 357 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM90A7PA6NKC0 464 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM210A6NLX4 147 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM90A22PA8MWA6 464 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM90A12PA8MX19 464 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 DHFRP00374 187 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM90A15PP0C7V4 464 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM90A13PP0C7W8 464 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM90A14PP0C7W9 464 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM90A24PP0C7X0 464 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 FUT3P21217 361 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 GRNP28799 593 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 CHRNB4P30926 498 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 BSPH1Q075Z2 132 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 IDO2Q6ZQW0 420 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF826PQ6ZT77 177 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM58AQ8N1B3 248 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 OR13G1Q8NGZ3 307 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 OR4K15Q8NH41 348 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 NRIP2Q9BQI9 281 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 TLNRD1Q9H1K6 362 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC2A8Q9NY64 477 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 UBE2QL1A1L167 161 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 ABCD4O14678 606 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 HPXP02790 462 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 PGA5P0DJD9 388 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 PTAFRP25105 342 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 CBX5P45973 191 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 ST3GAL2Q16842 350 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 TOR2AQ5JU69 321 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 NOXA1Q86UR1 476 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 OR8H3Q8N146 312 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 NUP37Q8NFH4 326 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 CXXC4Q9H2H0 198 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM221AA4D161 298 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM90A27PA6NNH2 459 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 TBPP20226 339 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 MEF2DQ14814 521 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 SPRNQ5BIV9 151 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 B8ZZF3 427 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 TRAPPC2P0DI81 140 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 TRAPPC2BP0DI82 140 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 VSIG10L2P0DP72 767 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 MPV17LQ2QL34 196 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 CHST6Q9GZX3 395 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 CA10Q9NS85 328 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 OR2AT4A6NND4 320 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 PRSS44E7EML9 344 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 TEX46H3BTG2 121 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 FCGR3AP08637 254 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 PMELP40967 661 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 VAX1Q5SQQ9 334 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 OR2Z1Q8NG97 314 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 GRPEL2Q8TAA5 225 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 PLK3Q9H4B4 646 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 FN3KRPQ9HA64 309 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 HES4Q9HCC6 221 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 CACNA1DQ01668 2161 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 TRAV24A0A0B4J272 114 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 PPP3CBP16298 524 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 AMY2BP19961 511 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 AKR1D1P51857 326 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 IKZF1Q13422 519 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 Q6P435 159 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 WDR82Q6UXN9 313 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 WDR13Q9H1Z4 485 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 RHOFQ9HBH0 211 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1B0GUH1 482 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 DTYMKP23919 212 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 GMFBP60983 142 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC22A25Q6T423 547 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 SSX8Q7RTT4 187 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 GALNT11Q8NCW6 608 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 OR5AP2Q8NGF4 316 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 PRRT1Q99946 306 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 SEC22CQ9BRL7 303 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 OR51J1Q9H342 316 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF442Q9H7R0 627 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-201ENST00000284957 IFT22Q9H7X7 185 aa7.9□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.3 ms