RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 TRAV40A0A0B4J280 105 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 TMEM72A0PK05 275 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 METTL21EPA6NDL7 271 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 F8VVB4 439 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 F8VWA3 439 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 MFNGO00587 321 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 SPDEFO95238 335 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 PDYNP01213 254 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 IGF2P01344 180 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 CD2P06729 351 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 SPARCP09486 303 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 LINC00614P0C842 121 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 ZNF35P13682 527 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 NDUFB7P17568 137 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 HLA-GP17693 338 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 CELP19835 753 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 S100A2P29034 98 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 DDTP30046 118 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 HTR1FP30939 366 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 IFNGR2P38484 337 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 MAP3K8P41279 467 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 MAGEB1P43366 347 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 SCAND1P57086 179 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 RAB1AP62820 205 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 NHLH2Q02577 135 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 GAGE1Q13065 139 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 COTL1Q14019 142 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 C9orf152Q5JTZ5 239 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 SLC35D3Q5M8T2 416 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 GLT8D1Q68CQ7 371 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 C1orf94Q6P1W5 598 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 CBLN3Q6UW01 205 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 Q6ZSV7 163 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 TMPPEQ6ZT21 453 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 C6orf120Q7Z4R8 191 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 ZFP82Q8N141 532 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 OR2L13Q8N349 312 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 LNX2Q8N448 690 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 SLC30A7Q8NEW0 376 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 OR1S2Q8NGQ3 325 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 OR5R1Q8NH85 324 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 MUC7Q8TAX7 377 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 PIGXQ8TBF5 258 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 CCDC107Q8WV48 283 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 RAB40AQ8WXH6 277 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 DYRK2Q92630 601 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 NRIP2Q9BQI9 281 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 CHST5Q9GZS9 411 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 TLNRD1Q9H1K6 362 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 C1orf198Q9H425 327 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 CALML5Q9NZT1 146 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 UPB1Q9UBR1 384 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 TNFSF18Q9UNG2 199 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 TMED3Q9Y3Q3 217 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 BTBD17A6NE02 478 aa9.76□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 GGT3PA6NGU5 568 aa9.76□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 MARCH11A6NNE9 402 aa9.76□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 J3QRE1 110 aa9.76□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 OR10H3O60404 316 aa9.76□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 CDC14BO60729 498 aa9.76□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 GATBO75879 557 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 AK1P00568 194 aa9.76□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 RBM34P42696 430 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 CRATP43155 626 aa9.76□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 PCP4P48539 62 aa9.76□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 BPIFB3P59826 476 aa9.76□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 PAX8Q06710 450 aa9.76□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 THEM4Q5T1C6 240 aa9.76□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 FRG2Q64ET8 278 aa9.76□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 ZNF546Q86UE3 836 aa9.76□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 LRP11Q86VZ4 500 aa9.76□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 NR2C2APQ86WQ0 139 aa9.76□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 GID4Q8IVV7 300 aa9.76□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 OR52E2Q8NGJ4 325 aa9.76□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 FCAMRQ8WWV6 532 aa9.76□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 SLAMF9Q96A28 289 aa9.76□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 SYT3Q9BQG1 590 aa9.76□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 BRF2Q9HAW0 419 aa9.76□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 TMEM27Q9HBJ8 222 aa9.76□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 NOX4Q9NPH5 578 aa9.76□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 TRIM36Q9NQ86 728 aa9.76□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 LAMP5Q9UJQ1 280 aa9.76□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa9.76□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.5 ms