RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 PRORYQ9H606 182 aa2.61□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 RNF167Q9H6Y7 350 aa2.61□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 NOX3Q9HBY0 568 aa2.61□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 SLC52A3Q9NQ40 469 aa2.61□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 CISHQ9NSE2 258 aa2.61□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 COMMD3Q9UBI1 195 aa2.61□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 NAT8BQ9UHF3 227 aa2.61□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa2.61□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa2.61□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 OR51B2Q9Y5P1 312 aa2.61□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 PTPRFP10586 1907 aa2.61□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 BCORL1Q5H9F3 1711 aa2.61□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 EVPLQ92817 2033 aa2.61□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 SIPA1L1O43166 1804 aa2.61□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 KIF21BO75037 1637 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 DCCP43146 1447 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 ARHGAP23Q9P227 1491 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 ATP7AQ04656 1500 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 A0A0G2JLM5 398 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 A0A1W2PPI3 338 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 CASTOR2A6NHX0 329 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 LILRA5A6NI73 299 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 COLCA2A8K830 154 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 E7ENX8 843 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 F5H5K5 113 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 J3KR12 359 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 M0R2Z0 102 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 MFNGO00587 321 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 VCYO14598 125 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF195O14628 629 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 FABP7O15540 132 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 CRXO43186 299 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 PLPP2O43688 288 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 SYNGR1O43759 233 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 ATP6AP2O75787 350 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 ATP5LO75964 103 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 NRASP01111 189 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 PMP2P02689 132 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 CATP04040 527 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 SEMG1P04279 462 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 IGF1P05019 195 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 UMODP07911 640 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 CT45A6P0DMU7 189 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 CT45A5P0DMU8 189 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 CT45A7P0DMV0 189 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 CYBAP13498 195 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 SPNP16150 400 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 GGT1P19440 569 aa2.6□□□□□ -1.99
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PTPRM-204ENST00000577468 ADORA2AP29274 412 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 AGTR1P30556 359 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 HRH1P35367 487 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 OR1E2P47887 323 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 SGSHP51688 502 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 PDX1P52945 283 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 EMP1P54849 157 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 XGP55808 180 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 GABARAPL2P60520 117 aa2.6□□□□□ -1.99
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PTPRM-204ENST00000577468 NCS1P62166 190 aa2.6□□□□□ -1.99
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PTPRM-204ENST00000577468 RPL24P83731 157 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
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PTPRM-204ENST00000577468 FAM53BQ14153 422 aa2.6□□□□□ -1.99
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PTPRM-204ENST00000577468 CLINT1Q14677 625 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 GUSBP1Q15486 140 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 SPHARQ15513 63 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 OR8B8Q15620 311 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 SSX1Q16384 188 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 LRRC26Q2I0M4 334 aa2.6□□□□□ -1.99
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PTPRM-204ENST00000577468 SLC25A52Q3SY17 297 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 CCSMST1Q4G0I0 132 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
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