RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 ETAA1Q9NY74 926 aa15.15■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM221AA4D161 298 aa15.14■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 CDIPTO14735 213 aa15.14■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 IFNA6P05013 189 aa15.14■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 RPS23P62266 143 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 GALNT11Q8NCW6 608 aa15.14■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 NUP37Q8NFH4 326 aa15.14■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM171Q8WVE6 324 aa15.14■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 ST6GAL2Q96JF0 529 aa15.14■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa15.14■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 SEC22CQ9BRL7 303 aa15.14■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa15.14■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 CXXC4Q9H2H0 198 aa15.14■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 DPRXA6NFQ7 191 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 HPXP02790 462 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 GMFBP60983 142 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 CD83Q01151 205 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM58AQ8N1B3 248 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR13G1Q8NGZ3 307 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 POM121Q96HA1 1249 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 MED28Q9H204 178 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF442Q9H7R0 627 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 NGBQ9NPG2 151 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 NKX2-6A6NCS4 301 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM90A10PA6NDY2 464 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM90A18PA6NE21 464 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM90A16PA6NEW6 464 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM90A7PA6NKC0 464 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM210A6NLX4 147 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM90A22PA8MWA6 464 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM90A12PA8MX19 464 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 IGHV3-13P01766 116 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM90A15PP0C7V4 464 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM90A13PP0C7W8 464 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM90A14PP0C7W9 464 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM90A24PP0C7X0 464 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 TBPP20226 339 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 IKZF1Q13422 519 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 NHLRC3Q5JS37 347 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR13C8Q8NGS7 320 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR5H2Q8NGV7 314 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 LRRC46Q96FV0 321 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 PRRT1Q99946 306 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 SYT3Q9BQG1 590 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 CHST6Q9GZX3 395 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF221Q9UK13 617 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa15.12■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 PRAF2O60831 178 aa15.12■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 VSIG10L2P0DP72 767 aa15.12■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 MAB21L1Q13394 359 aa15.12■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 FCN2Q15485 313 aa15.12■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa15.12■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 PRR7Q8TB68 274 aa15.12■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 DMRTB1Q96MA1 342 aa15.12■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa15.12■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 COL6A6A6NMZ7 2263 aa15.11■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 ABCD4O14678 606 aa15.11■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR3A3P47888 321 aa15.11■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 SORDQ00796 357 aa15.11■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 BSPH1Q075Z2 132 aa15.11■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 CDSNQ15517 529 aa15.11■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 MPV17LQ2QL34 196 aa15.11■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 CHRFAM7AQ494W8 412 aa15.11■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 ACTBL2Q562R1 376 aa15.11■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF826PQ6ZT77 177 aa15.11■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 SPERTQ8NA61 448 aa15.11■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR2Z1Q8NG97 314 aa15.11■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 PLK3Q9H4B4 646 aa15.11■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC2A8Q9NY64 477 aa15.11■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 HSPB6O14558 160 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 SSNA1O43805 119 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 MECP2P51608 486 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 TAS2R46P59540 309 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 C4orf17Q53FE4 359 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 METTL11BQ5VVY1 283 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMED4Q7Z7H5 227 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 C11orf53Q8IXP5 236 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR52B4Q8NGK2 314 aa15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms