RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552295.5

BEST3-211, Transcript of bestrophin 3, humanhuman

TSL 5

Gene BEST3, Length 720 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST3-211ENST00000552295 SCCPDHQ8NBX0 429 aa6.78□□□□□ -1.32
BEST3-211ENST00000552295 TMEM104Q8NE00 496 aa6.78□□□□□ -1.32
BEST3-211ENST00000552295 ITLN1Q8WWA0 313 aa6.78□□□□□ -1.32
BEST3-211ENST00000552295 AQP3Q92482 292 aa6.78□□□□□ -1.32
BEST3-211ENST00000552295 SLC25A38Q96DW6 304 aa6.78□□□□□ -1.32
BEST3-211ENST00000552295 OR2V2Q96R30 315 aa6.78□□□□□ -1.32
BEST3-211ENST00000552295 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
BEST3-211ENST00000552295 MS4A5Q9H3V2 200 aa6.78□□□□□ -1.32
BEST3-211ENST00000552295 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa6.78□□□□□ -1.32
BEST3-211ENST00000552295 UBTD1Q9HAC8 227 aa6.78□□□□□ -1.32
BEST3-211ENST00000552295 DYNLRB1Q9NP97 96 aa6.78□□□□□ -1.32
BEST3-211ENST00000552295 CBLN4Q9NTU7 201 aa6.78□□□□□ -1.32
BEST3-211ENST00000552295 FAIMQ9NVQ4 179 aa6.78□□□□□ -1.32
BEST3-211ENST00000552295 IL36GQ9NZH8 169 aa6.78□□□□□ -1.32
BEST3-211ENST00000552295 MTCH1Q9NZJ7 389 aa6.78□□□□□ -1.32
BEST3-211ENST00000552295 GHRLQ9UBU3 117 aa6.78□□□□□ -1.32
BEST3-211ENST00000552295 IL19Q9UHD0 177 aa6.78□□□□□ -1.32
BEST3-211ENST00000552295 ING4Q9UNL4 249 aa6.78□□□□□ -1.32
BEST3-211ENST00000552295 PEX16Q9Y5Y5 336 aa6.78□□□□□ -1.32
BEST3-211ENST00000552295 ETV7Q9Y603 341 aa6.78□□□□□ -1.32
BEST3-211ENST00000552295 DYSFO75923 2080 aa6.78□□□□□ -1.32
BEST3-211ENST00000552295 CACNA1DQ01668 2161 aa6.78□□□□□ -1.32
BEST3-211ENST00000552295 DSCAMO60469 2012 aa6.77□□□□□ -1.32
BEST3-211ENST00000552295 A0A1W2PP11 408 aa6.77□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 A6NLC8 198 aa6.77□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 F8VVB4 439 aa6.77□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 F8VWA3 439 aa6.77□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 CDIPTO14735 213 aa6.77□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 KDM4BO94953 1096 aa6.77□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 SFTPBP07988 381 aa6.77□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 ELK1P19419 428 aa6.77□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 SERPINA2P20848 420 aa6.77□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 TNFSF4P23510 183 aa6.77□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 TNFSF8P32971 234 aa6.77□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 PMELP40967 661 aa6.77□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 RANBP1P43487 201 aa6.77□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 SRP9P49458 86 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 CCL8P80075 99 aa6.77□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 RSU1Q15404 277 aa6.77□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 SLC22A6Q4U2R8 563 aa6.77□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 UBE2NLQ5JXB2 153 aa6.77□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 AGAP6Q5VW22 663 aa6.77□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 WDR82Q6UXN9 313 aa6.77□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 Q6ZPA2 131 aa6.77□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 LINC00299Q6ZSB3 139 aa6.77□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 ZNF826PQ6ZT77 177 aa6.77□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 BIVMQ86UB2 503 aa6.77□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 MKXQ8IYA7 352 aa6.77□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 Q8NFD4 153 aa6.77□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 OR10K1Q8NGX5 313 aa6.77□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 OR51F2Q8NH61 342 aa6.77□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 KCNG3Q8TAE7 436 aa6.77□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 FAM46BQ96A09 425 aa6.77□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 SLAMF9Q96A28 289 aa6.77□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 PTX4Q96A99 478 aa6.77□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 CMTM3Q96MX0 182 aa6.77□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 WDFY2Q96P53 400 aa6.77□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 S100A13Q99584 98 aa6.77□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 METTL9Q9H1A3 318 aa6.77□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 ABCG5Q9H222 651 aa6.77□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 UFSP2Q9NUQ7 469 aa6.77□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 RHBDL2Q9NX52 303 aa6.77□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa6.77□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 ABCA4P78363 2273 aa6.76□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 ROS1P08922 2347 aa6.76□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 CYB5AP00167 134 aa6.76□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 APOA1P02647 267 aa6.76□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 PGA5P0DJD9 388 aa6.76□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 MGMTP16455 207 aa6.76□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 BCL3P20749 454 aa6.76□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 S100A5P33763 92 aa6.76□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 CFHR2P36980 270 aa6.76□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 RBMXP38159 391 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 NPBWR2P48146 333 aa6.76□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 ART1P52961 327 aa6.76□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 ERVK11-1P61568 191 aa6.76□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 GPR176Q14439 515 aa6.76□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 PCGF3Q3KNV8 242 aa6.76□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 ELP2Q6IA86 826 aa6.76□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 CNIH2Q6PI25 160 aa6.76□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 Q6ZRM9 215 aa6.76□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 CCDC190Q86UF4 302 aa6.76□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 MOGAT3Q86VF5 341 aa6.76□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 CMTM4Q8IZR5 234 aa6.76□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 BATF2Q8N1L9 274 aa6.76□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 POC1AQ8NBT0 407 aa6.76□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 IGFBPL1Q8WX77 278 aa6.76□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 C14orf79Q96F83 325 aa6.76□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 CEP19Q96LK0 163 aa6.76□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 ZNF488Q96MN9 340 aa6.76□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 NRIP2Q9BQI9 281 aa6.76□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 TMEM59Q9BXS4 323 aa6.76□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 EGLN1Q9GZT9 426 aa6.76□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 CST11Q9H112 138 aa6.76□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 LPAR5Q9H1C0 372 aa6.76□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms