RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551931.5

LETMD1-231, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-231	ENST00000551931	GABRR1	P24046	479 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-231	ENST00000551931	HTR1D	P28221	377 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-231	ENST00000551931	DUSP1	P28562	367 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-231	ENST00000551931	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-231	ENST00000551931	NPBWR2	P48146	333 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF91	Q05481	1191 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-231	ENST00000551931	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-231	ENST00000551931	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-231	ENST00000551931	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-231	ENST00000551931	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-231	ENST00000551931	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-231	ENST00000551931	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-231	ENST00000551931	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-231	ENST00000551931	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-231	ENST00000551931	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-231	ENST00000551931	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-231	ENST00000551931	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-231	ENST00000551931	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM172BP	A6NC97	362 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	CALCB	P10092	127 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	CALB2	P22676	271 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	PEX2	P28328	305 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	OR3A1	P47881	315 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	IL18R1	Q13478	541 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	MNT	Q99583	582 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	TBX5	Q99593	518 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	CHST5	Q9GZS9	411 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	CLN6	Q9NWW5	311 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	DPM3	Q9P2X0	92 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	SYT7	O43581	403 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	FKBP6	O75344	327 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	ENTPD6	O75354	484 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	IGLV1-47	P01700	117 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	BCL3	P20749	454 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	EPHA2	P29317	976 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	GDNF	P39905	211 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	DAP	P51397	102 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	FUT6	P51993	359 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	P2RX3	P56373	397 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	ACTR3	P61158	418 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	CBX1	P83916	185 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	EFNB1	P98172	346 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	BDH1	Q02338	343 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	FAHD1	Q6P587	224 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	THTPA	Q9BU02	230 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		10	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931		H3BUI4	141 aa		10	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	SIRPB1	O00241	398 aa		10	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	MGST3	O14880	152 aa		10	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	OR2F2	O95006	317 aa		10	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	KRT8	P05787	483 aa		10	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	CDK2	P24941	298 aa		10	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	BRS3	P32247	399 aa		10	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	CD69	Q07108	199 aa		10	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF146	Q15072	292 aa		10	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	UTF1	Q5T230	341 aa		10	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	SPATA24	Q86W54	205 aa		10	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		10	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		10	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		10	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM163	Q8TC26	289 aa		10	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		10	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		10	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	STMN2	Q93045	179 aa		10	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	BORCS8	Q96FH0	119 aa		10	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		10	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	HHLA2	Q9UM44	414 aa		10	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		9.99	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		9.99	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	LEUTX	A8MZ59	168 aa		9.99	□□□□□ -0.81
LETMD1-231	ENST00000551931	ATP8B1	O43520	1251 aa		9.99	□□□□□ -0.81

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.9 ms