RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 GAB2Q9UQC2 676 aa7.51□□□□□ -1.21
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PTPRB-208ENST00000550358 PRR33A8MZF0 331 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-208ENST00000550358 SIX6O95475 246 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-208ENST00000550358 HLA-DRB3P79483 266 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-208ENST00000550358 HYAL4Q2M3T9 481 aa7.51□□□□□ -1.21
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PTPRB-208ENST00000550358 YBX1P67809 324 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-208ENST00000550358 XAF1Q6GPH4 301 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-208ENST00000550358 FCGR3BO75015 233 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-208ENST00000550358 CFDP00746 253 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-208ENST00000550358 IGLV3-19P01714 112 aa7.49□□□□□ -1.21
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