RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 FNDC7Q5VTL7 733 aa8.34□□□□□ -1.07
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PTPRB-204ENST00000538708 EPXP11678 715 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 ID1P41134 155 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 LOXL3P58215 753 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 CHRDL1Q9BU40 450 aa8.32□□□□□ -1.08
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