RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522978.1

UBXN2B-204, Transcript of UBX domain protein 2B, humanhuman

TSL 3

Gene UBXN2B, Length 717 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2B-204ENST00000522978 ZNRF1Q8ND25 227 aa14.66□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 LY6G5BQ8NDX9 201 aa14.66□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 UPRTQ96BW1 309 aa14.66□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 OR14A2Q96R54 314 aa14.66□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 DCTN5Q9BTE1 182 aa14.66□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 TMEM138Q9NPI0 162 aa14.66□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa14.65□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 ZNF879B4DU55 563 aa14.65□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 MAGEB3O15480 346 aa14.65□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 IGKV1D-12P01611 117 aa14.65□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 ALDOBP05062 364 aa14.65□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 NPBWR2P48146 333 aa14.65□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 UBA52P62987 128 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 GPR50Q13585 617 aa14.65□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 SPIN3Q5JUX0 258 aa14.65□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 FAM58AQ8N1B3 248 aa14.65□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 TMEM185AQ8NFB2 350 aa14.65□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 OR5D18Q8NGL1 313 aa14.65□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 DUX5Q96PT3 197 aa14.65□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 DERL3Q96Q80 235 aa14.65□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 CCDC90BQ9GZT6 254 aa14.65□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 ISYNA1Q9NPH2 558 aa14.65□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 CKLFQ9UBR5 152 aa14.65□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 OR14J1Q9UGF5 321 aa14.65□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 VWFP04275 2813 aa14.65□□□□□ -0.06
UBXN2B-204ENST00000522978 ANGPTL7O43827 346 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 MMP9P14780 707 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 FGF12P61328 243 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 ZNF146Q15072 292 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 MS4A15Q8N5U1 240 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 KIR3DL3Q8N743 410 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 OR52N4Q8NGI2 321 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 ORAI1Q96D31 301 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 FAM234AQ9H0X4 552 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 HMG20AQ9NP66 347 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 IL36RNQ9UBH0 155 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 GABRPO00591 440 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 INMTO95050 263 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 TMEM225BP0DP42 221 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 NDUFB7P17568 137 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 BDKRB2P30411 391 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 DDI2Q5TDH0 399 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 PXT1Q8NFP0 134 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 UFD1Q92890 307 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 WDFY2Q96P53 400 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 GPER1Q99527 375 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 SIRPDQ9H106 197 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 FOXJ3Q9UPW0 622 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 KPTNQ9Y664 436 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 ZNF737O75373 536 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 SC5DO75845 299 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 HAND1O96004 215 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 SFTPBP07988 381 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 CHRM2P08172 466 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 PRKACAP17612 351 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 CAPZA1P52907 286 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 COL10A1Q03692 680 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 TPBGQ13641 420 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 METTL11BQ5VVY1 283 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 LIPKQ5VXJ0 399 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 ZNF747Q9BV97 191 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 CNTD2Q9H8S5 307 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 NUP50Q9UKX7 468 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 TRAV40A0A0B4J280 105 aa14.61□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 MAGEA13PA6NCF6 341 aa14.61□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 K7N7A8 449 aa14.61□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 PIN1P1O15428 100 aa14.61□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 TOX4O94842 621 aa14.61□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 TK1P04183 234 aa14.61□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 HSMCR30P0CW71 290 aa14.61□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 CPEP16870 476 aa14.61□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 FPR2P25090 351 aa14.61□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 TGFBR2P37173 567 aa14.61□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 MAP2K4P45985 399 aa14.61□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 BMXP51813 675 aa14.61□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 TUSC1Q2TAM9 212 aa14.61□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 PRR31Q5SQ13 230 aa14.61□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 ELP2Q6IA86 826 aa14.61□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa14.61□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 ASCL4Q6XD76 172 aa14.61□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 ZNF367Q7RTV3 350 aa14.61□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 SATL1Q86VE3 508 aa14.61□□□□□ -0.07
UBXN2B-204ENST00000522978 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms