RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521418.1

POLB-210, Transcript of DNA polymerase beta, humanhuman

TSL 2

Gene POLB, Length 628 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLB-210ENST00000521418 SLC37A3Q8NCC5 494 aa5.06□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa5.06□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 OR56B2PQ8NGI1 322 aa5.06□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa5.06□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 ANGPTL6Q8NI99 470 aa5.06□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 TMEM163Q8TC26 289 aa5.06□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 CREB3L1Q96BA8 519 aa5.06□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 Q96MT0 163 aa5.06□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa5.06□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 NMNAT3Q96T66 252 aa5.06□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 MNTQ99583 582 aa5.06□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 ADI1Q9BV57 179 aa5.06□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa5.06□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 SNTG1Q9NSN8 517 aa5.06□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP5.06□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 HILPDAQ9Y5L2 63 aa5.06□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 GMPPBQ9Y5P6 360 aa5.06□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 IRGMA1A4Y4 181 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 SERPINE3A8MV23 424 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 FAM90A22PA8MWA6 464 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 ODF3BA8MYP8 253 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 MITFO75030 526 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 HLA-DQA2P01906 255 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 APOC1P02654 83 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 OR8U8P0C7N1 319 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 IGHV1-8P0DP01 117 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 SELLP14151 372 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 ZNF823P16415 610 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 SPI1P17947 270 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 HTR1DP28221 377 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 CEACAM3P40198 252 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 MNDAP41218 407 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 POU3F4P49335 361 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 RPS7P62081 194 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 CSNK2BP67870 215 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 ZNF92Q03936 586 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 KIR2DS1Q14954 304 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 TAF13Q15543 124 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 TIGD6Q17RP2 521 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 LPCAT4Q643R3 524 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 TEX38Q6PEX7 206 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 LCNL1Q6ZST4 164 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 SHFQ7M4L6 423 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 OR6V1Q8N148 313 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 DRAM1Q8N682 238 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 TCEANCQ8N8B7 351 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 ZNRF1Q8ND25 227 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 OR11H6Q8NGC7 330 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 OR6K6Q8NGW6 343 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 OR2T27Q8NH04 317 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 ZNF671Q8TAW3 534 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 CYGBQ8WWM9 190 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 LINC00476Q8WZB0 136 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 OTULINQ96BN8 352 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 IL4I1Q96RQ9 567 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 INTS14Q96SY0 518 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 MBOAT4Q96T53 435 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 SLC29A1Q99808 456 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 NUAK2Q9H093 628 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 FAM118AQ9NWS6 357 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 CLN6Q9NWW5 311 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 TVP23BQ9NYZ1 205 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 B9D1Q9UPM9 204 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 MPC1Q9Y5U8 109 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 LHFPL6Q9Y693 200 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 STARD9Q9P2P6 4700 aa5.05□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 OR6C68A6NDL8 312 aa5.04□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 PRKYO43930 277 aa5.04□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 HCKP08631 526 aa5.04□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 FAM106CPP0CH98 169 aa5.04□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 HTR1FP30939 366 aa5.04□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 ACTC1P68032 377 aa5.04□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 ACTA1P68133 377 aa5.04□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 MED21Q13503 144 aa5.04□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 SMIM21Q3B7S5 101 aa5.04□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa5.04□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 TEX30Q5JUR7 227 aa5.04□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 GLYATL3Q5SZD4 288 aa5.04□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 ZNF691Q5VV52 312 aa5.04□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 TMEM236Q5W0B7 351 aa5.04□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 TMEM200BQ69YZ2 307 aa5.04□□□□□ -1.6
POLB-210ENST00000521418 CORO6Q6QEF8 472 aa5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms