RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa3.47□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 G3V2L1 256 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 TRAPPC2LH3BP13 241 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 SULT2B1O00204 365 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 PHOX2AO14813 284 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 APOA1P02647 267 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 KLK1P06870 262 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 IMPDH1P20839 514 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 C4BPBP20851 252 aa3.46□□□□□ -1.86
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PDE4D-217ENST00000509355 ID1P41134 155 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 CRYBB2P43320 205 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 P2RY1P47900 373 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 RPS23P62266 143 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 RAB11AP62491 216 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 SLC35A2P78381 396 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
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PDE4D-217ENST00000509355 RBBP4Q09028 425 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 TSNQ15631 228 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 RAB11BQ15907 218 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 TSPO2Q5TGU0 170 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 SLX4IPQ5VYV7 408 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 FAM45BPQ6NSW5 357 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 C3orf33Q6P1S2 294 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 ERICH5Q6P6B1 374 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 LRRN1Q6UXK5 716 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 PAGE2Q7Z2X7 111 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 METTL4Q8N3J2 472 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 SDR9C7Q8NEX9 313 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 OR7G2Q8NG99 324 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 OR10A7Q8NGE5 316 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 OR9A2Q8NGT5 310 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 CNIH3Q8TBE1 160 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 PIGXQ8TBF5 258 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 FAM45AQ8TCE6 357 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 LIPHQ8WWY8 451 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 RBBP8Q99708 897 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 FAIM2Q9BWQ8 316 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 CHID1Q9BWS9 393 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 ANKRD60Q9BZ19 345 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 TUBB1Q9H4B7 451 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 NANOGQ9H9S0 305 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 TMEM165Q9HC07 324 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 AHSPQ9NZD4 102 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 IL36GQ9NZH8 169 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 CD274Q9NZQ7 290 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 MBD2Q9UBB5 411 aa3.46□□□□□ -1.86
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PDE4D-217ENST00000509355 CMYA5Q8N3K9 4069 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 RYR1P21817 5038 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 C12orf71A8MTZ7 269 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 NPIPB9F8W1W9 429 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 PDLIM1O00151 329 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 RTL8CO15255 209 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 TAPBPO15533 448 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 HMOX2P30519 316 aa3.45□□□□□ -1.86
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PDE4D-217ENST00000509355 ARR3P36575 388 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 TGFBR2P37173 567 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 PLP1P60201 277 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 CDK16Q00536 496 aa3.45□□□□□ -1.86
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PDE4D-217ENST00000509355 APOOLQ6UXV4 268 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 C4orf22Q6V702 233 aa3.45□□□□□ -1.86
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PDE4D-217ENST00000509355 MMGT1Q8N4V1 131 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 DHRSXQ8N5I4 330 aa3.45□□□□□ -1.86
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PDE4D-217ENST00000509355 OR1K1Q8NGR3 316 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF675Q8TD23 568 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 IL4I1Q96RQ9 567 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 SERPINI1Q99574 410 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 NMUR2Q9GZQ4 415 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 NOX3Q9HBY0 568 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 PTTG3PQ9NZH4 202 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 TAAR3PQ9P1P4 343 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 SLC17A7Q9P2U7 560 aa3.45□□□□□ -1.86
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