RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 PSMB9P28065 219 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 ZP1P60852 638 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 PAX8Q06710 450 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 METTL11BQ5VVY1 283 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 JAGN1Q8N5M9 183 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 KIR3DL3Q8N743 410 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 C8orf46Q8TAG6 207 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 RFT1Q96AA3 541 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF488Q96MN9 340 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 DCTN5Q9BTE1 182 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 NDUFB11Q9NX14 153 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 METRNQ9UJH8 293 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 KPTNQ9Y664 436 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 MTORP42345 2549 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 K7N7A8 449 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 GABRPO00591 440 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 HAND1O96004 215 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 TK1P04183 234 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 MAS1P04201 325 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 GTF2F2P13984 249 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 MYL9P24844 172 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 FPR2P25090 351 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 IL13RA2Q14627 380 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 PDCD1Q15116 288 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 GDPD3Q7L5L3 318 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 C1QL2Q7Z5L3 287 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM216BQ8N7L0 139 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 Q8NFD4 153 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 TSPAN14Q8NG11 270 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 OR5D18Q8NGL1 313 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM203Q969S6 136 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 SPACA5Q96QH8 159 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A1W2PPK0 400 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A1W2PQ09 198 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 MGST3O14880 152 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 DEGS1O15121 323 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 ANGPTL7O43827 346 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 NPBWR2P48146 333 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 KCNJ3P48549 501 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 PAX2Q02962 417 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM189A2Q15884 450 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 DGUOKQ16854 277 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 NHLRC3Q5JS37 347 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 OR8H2Q8N162 312 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 OSR2Q8N2R0 312 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 CD177Q8N6Q3 437 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNRF1Q8ND25 227 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 LY6G5BQ8NDX9 201 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 OR51T1Q8NGJ9 327 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 SEH1LQ96EE3 360 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 CST11Q9H112 138 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF696Q9H7X3 374 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 SPACA1Q9HBV2 294 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 MMP26Q9NRE1 261 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 SSR3Q9UNL2 185 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 MAB21L2Q9Y586 359 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 TLN2Q9Y4G6 2542 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 M0R1W7 72 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 PIN1P1O15428 100 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 HTR3BO95264 441 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 BPNT1O95861 308 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF44P15621 663 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 ADRA2CP18825 462 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 AMY2BP19961 511 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 GABRR1P24046 479 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 LMO1P25800 156 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 ERP29P30040 261 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 RPL31P62899 125 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 COL10A1Q03692 680 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 MPV17LQ2QL34 196 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 AWAT2Q6E213 333 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 ASPHD2Q6ICH7 369 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 UPRTQ96BW1 309 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 STUB1Q9UNE7 303 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A0A6YYJ9 748 aa12.04□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa12.04□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa12.04□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 hADV38S2A0JD32 116 aa12.04□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM90A10PA6NDY2 464 aa12.04□□□□□ -0.48
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM90A18PA6NE21 464 aa12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms