RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495123.5

PKP4-216, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 580 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-216ENST00000495123 PHC2Q8IXK0 858 aa7.15□□□□□ -1.26
PKP4-216ENST00000495123 Q8IYB0 196 aa7.15□□□□□ -1.26
PKP4-216ENST00000495123 SPARTQ8N0X7 666 aa7.15□□□□□ -1.26
PKP4-216ENST00000495123 FAM58AQ8N1B3 248 aa7.15□□□□□ -1.26
PKP4-216ENST00000495123 MS4A15Q8N5U1 240 aa7.15□□□□□ -1.26
PKP4-216ENST00000495123 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PKP4-216ENST00000495123 TMEM185AQ8NFB2 350 aa7.15□□□□□ -1.26
PKP4-216ENST00000495123 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa7.15□□□□□ -1.26
PKP4-216ENST00000495123 TMEM203Q969S6 136 aa7.15□□□□□ -1.26
PKP4-216ENST00000495123 MED30Q96HR3 178 aa7.15□□□□□ -1.26
PKP4-216ENST00000495123 GPER1Q99527 375 aa7.15□□□□□ -1.26
PKP4-216ENST00000495123 DCTN5Q9BTE1 182 aa7.15□□□□□ -1.26
PKP4-216ENST00000495123 MRI1Q9BV20 369 aa7.15□□□□□ -1.26
PKP4-216ENST00000495123 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PKP4-216ENST00000495123 FAM192AQ9GZU8 254 aa7.15□□□□□ -1.26
PKP4-216ENST00000495123 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PKP4-216ENST00000495123 HMG20AQ9NP66 347 aa7.15□□□□□ -1.26
PKP4-216ENST00000495123 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PKP4-216ENST00000495123 FOXJ3Q9UPW0 622 aa7.15□□□□□ -1.26
PKP4-216ENST00000495123 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PKP4-216ENST00000495123 AUP1Q9Y679 476 aa7.15□□□□□ -1.26
PKP4-216ENST00000495123 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 TMEM82A0PJX8 343 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 ZNF737O75373 536 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 CDRT1O95170 752 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 ECDO95905 644 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 HAND1O96004 215 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 FSHBP01225 129 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 MMP9P14780 707 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 CAPZA1P52907 286 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 CAV3P56539 151 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 FGF12P61328 243 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 ZNF146Q15072 292 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 PDCD1Q15116 288 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 SSX1Q16384 188 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 ARMCX4Q5H9R4 360 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 CEACAM19Q7Z692 300 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 LYPD6Q86Y78 171 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 SAXO1Q8IYX7 474 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 SVOPQ8N4V2 548 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 ZNF561Q8N587 486 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 LY6G5BQ8NDX9 201 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 PXT1Q8NFP0 134 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 OR10K1Q8NGX5 313 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 CKLFQ9UBR5 152 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 LRRC42Q9Y546 428 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.273e-10■■■□□ 16.3
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PKP4-216ENST00000495123 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 A0A1W2PP11 408 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 K7N7A8 449 aa7.13□□□□□ -1.27
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PKP4-216ENST00000495123 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 PTGFRP43088 359 aa7.13□□□□□ -1.27
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PKP4-216ENST00000495123 ARF6P62330 175 aa7.13□□□□□ -1.27
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PKP4-216ENST00000495123 ZNF773Q6PK81 442 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 ASCL4Q6XD76 172 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 C17orf107Q6ZR85 190 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 LRRTM1Q86UE6 522 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 JAGN1Q8N5M9 183 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
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PKP4-216ENST00000495123 OR4M1Q8NGD0 313 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 C8orf46Q8TAG6 207 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 NANPQ8TBE9 248 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 THRSPQ92748 146 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 MUL1Q969V5 352 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 UPRTQ96BW1 309 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 TBX15Q96SF7 602 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 CHST6Q9GZX3 395 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 FAM234AQ9H0X4 552 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 SIRPDQ9H106 197 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 CNTD2Q9H8S5 307 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 C19orf12Q9NSK7 152 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 ING4Q9UNL4 249 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 HIVEP2P31629 2446 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 TRAV40A0A0B4J280 105 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 SIRPB1O00241 398 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 LCE2BO14633 110 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 TOX4O94842 621 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 HTR3BO95264 441 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 OR2H2O95918 312 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 SERPINA2P20848 420 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-216ENST00000495123 EPHA1P21709 976 aa7.12□□□□□ -1.27
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