RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 C11orf42Q8N5U0 333 aa6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 Q8WTZ3 238 aa6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 PGAM5Q96HS1 289 aa6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 DEPPQ9NTK1 212 aa6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 LRFN1Q9P244 771 aa6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 SDK1Q7Z5N4 2213 aa6.69□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 A0A087WWC5 75 aa6.69□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 A0A087WZY1 265 aa6.69□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 TRAV17A0A0B4J275 112 aa6.69□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa6.69□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 MEIS3P1A6NDR6 274 aa6.69□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 UNC119BA6NIH7 251 aa6.69□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 AQP7O14520 342 aa6.69□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 DOK2O60496 412 aa6.69□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 GPANK1O95872 356 aa6.69□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 AMY2AP04746 511 aa6.69□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 TRGC1P0CF51 173 aa6.69□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 ADRA2CP18825 462 aa6.69□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 DTYMKP23919 212 aa6.69□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 HSD11B1P28845 292 aa6.69□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 PPP1R1AQ13522 171 aa6.69□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 PRAMEF20Q5VT98 475 aa6.69□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 TMEM268Q5VZI3 342 aa6.69□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 OLIG3Q7RTU3 272 aa6.69□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 BCORP1Q8N888 145 aa6.69□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa6.69□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 OR52L1Q8NGH7 329 aa6.69□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 OR13C2Q8NGS9 318 aa6.69□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 OR2S2Q9NQN1 319 aa6.69□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 RNF150Q9ULK6 438 aa6.69□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 VSIG4Q9Y279 399 aa6.69□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 AMDHD2Q9Y303 409 aa6.69□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 PPIAL4AQ9Y536 164 aa6.69□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 TSPAN15O95858 294 aa6.69□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 GCGP01275 180 aa6.69□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 THY1P04216 161 aa6.69□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 OR2T7P0C7T2 308 aa6.69□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 PRSS54Q6PEW0 395 aa6.69□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 HMGN2P46Q86SG4 172 aa6.69□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 OR2T27Q8NH04 317 aa6.69□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 TMEM255BQ8WV15 326 aa6.69□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 TAAR6Q96RI8 345 aa6.69□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 PCGF1Q9BSM1 259 aa6.69□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 SLC35B3Q9H1N7 401 aa6.69□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 DKKL1Q9UK85 242 aa6.69□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 TRAV18A0A075B6X5 111 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 LOC100509620A0A075B734 347 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 A8MVM7 634 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 TRGC2P03986 189 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 RAB6AP20340 208 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 UCP3P55916 312 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 HAGHQ16775 308 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 C1orf194Q5T5A4 169 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 GDF7Q7Z4P5 450 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 CMTM1Q8IZ96 169 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 CD300LFQ8TDQ1 290 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 FRZBQ92765 325 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 SLC35G5Q96KT7 338 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 GNRHR2Q96P88 292 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 FAM173AQ9BQD7 235 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 CST11Q9H112 138 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 KCNJ16Q9NPI9 418 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 B3GAT1Q9P2W7 334 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 COPS7AQ9UBW8 275 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 HCFC1P51610 2035 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 M0QYG6 137 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 TOMM40O96008 361 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 CFPP27918 469 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 IL13RA1P78552 427 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 HSPB3Q12988 150 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 ATP6V1FQ16864 119 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 ZNF343Q6P1L6 599 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 BRICD5Q6PL45 260 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 ZADH2Q8N4Q0 377 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 FAM89BQ8N5H3 189 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 TMEM104Q8NE00 496 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 OR2M7Q8NG81 312 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 PRRT1Q99946 306 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 TTTY10Q9BZA0 68 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 SLC2A8Q9NY64 477 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 PITPNC1Q9UKF7 332 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 ICAM5Q9UMF0 924 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 C5orf51A6NDU8 294 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 DHRS7CA6NNS2 312 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 FRS3O43559 492 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 BRI3O95415 125 aa6.68□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
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