RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480816.5

CDC25B-208, Transcript of cell division cycle 25B, human

TSL 5

Gene CDC25B, Length 807 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CDC25B-208	ENST00000480816	PRKACA	P17612	351 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	BCL3	P20749	454 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	NPBWR2	P48146	333 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	SOX2	P48431	317 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	TAS2R43	P59537	309 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	KISS1	Q15726	138 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816		Q6YL49	198 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	AHSA2	Q719I0	299 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	SNX22	Q96L94	193 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	SPACA5	Q96QH8	159 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	HMG20A	Q9NP66	347 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816		H0YHG0	523 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	MYL12B	O14950	172 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	ANGPTL7	O43827	346 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	KDM4B	O94953	1096 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	LALBA	P00709	142 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	AQP4	P55087	323 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	ZNF529	Q6P280	563 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	OR8H2	Q8N162	312 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	TMEM86B	Q8N661	226 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	TNFRSF14	Q92956	283 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	TMEM106A	Q96A25	262 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	DUX5	Q96PT3	197 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816		A0A0U1RQK1	487 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	IGKV1D-12	P01611	117 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	TMEM225B	P0DP42	221 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	UBE2E1	P51965	193 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	ZP1	P60852	638 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	PPP3R1	P63098	170 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	ACSM1	Q08AH1	577 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	GHSR	Q92847	366 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	SCN3B	Q9NY72	215 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	TMEM82	A0PJX8	343 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	NPFF	O15130	113 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	MELTF	P08582	738 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	FBP1	P09467	338 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	HKR1	P10072	659 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	GABRR1	P24046	479 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	DUSP1	P28562	367 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	BMX	P51813	675 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	WNT4	P56705	351 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	EDDM3B	P56851	147 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816		Q499Y3	187 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	RNLS	Q5VYX0	342 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	RNF144B	Q7Z419	303 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	PXT1	Q8NFP0	134 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	GPER1	Q99527	375 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CDC25B-208	ENST00000480816	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CDC25B-208	ENST00000480816	SH2D1B	O14796	132 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CDC25B-208	ENST00000480816	ALDOB	P05062	364 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CDC25B-208	ENST00000480816	CDK1	P06493	297 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CDC25B-208	ENST00000480816	CALCB	P10092	127 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CDC25B-208	ENST00000480816	MTNR1B	P49286	362 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CDC25B-208	ENST00000480816	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CDC25B-208	ENST00000480816	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CDC25B-208	ENST00000480816	FOXL1	Q12952	345 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CDC25B-208	ENST00000480816	KLRD1	Q13241	179 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CDC25B-208	ENST00000480816	ZNF273	Q14593	569 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CDC25B-208	ENST00000480816	GRK1	Q15835	563 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CDC25B-208	ENST00000480816	C16orf87	Q6PH81	154 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CDC25B-208	ENST00000480816	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CDC25B-208	ENST00000480816	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CDC25B-208	ENST00000480816	MYDGF	Q969H8	173 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CDC25B-208	ENST00000480816	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CDC25B-208	ENST00000480816	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		13.58	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.3 ms