RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC2A9Q9NRM0 540 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 MMACHCQ9Y4U1 282 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 A0A087X0M5 115 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 A0A1B0GX30 115 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 IGSF23A1L1A6 192 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 CST7O76096 145 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 SRP19P09132 144 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 TRGC1P0CF51 173 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 PGA4P0DJD7 388 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 PGA3P0DJD8 388 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 CTHP32929 405 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 UEVLDQ8IX04 471 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM171Q8WVE6 324 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 FRZBQ92765 325 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 DDIT4LQ96D03 193 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 C2orf88Q9BSF0 95 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 GPR173Q9NS66 373 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC7A11Q9UPY5 501 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 PIGLQ9Y2B2 252 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 OR5H15A6NDH6 313 aa11.78□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 OR5H1A6NKK0 313 aa11.78□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 VSTM2BA6NLU5 285 aa11.78□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 TERTO14746 1132 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 RRP8O43159 456 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 IGHG1P01857 330 aa11.78□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 DUSP1P28562 367 aa11.78□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 SFTPDP35247 375 aa11.78□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 THEM4Q5T1C6 240 aa11.78□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC35G3Q8N808 338 aa11.78□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 ABHD5Q8WTS1 349 aa11.78□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 CRLF2Q9HC73 371 aa11.78□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 CYP8B1Q9UNU6 501 aa11.78□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 GABRG2P18507 467 aa11.78□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC22A25Q6T423 547 aa11.78□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 LIAT1Q6ZQX7 453 aa11.78□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 C5orf24Q7Z6I8 188 aa11.78□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 BOD1Q96IK1 185 aa11.78□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 SNX22Q96L94 193 aa11.78□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 SIRT7Q9NRC8 400 aa11.78□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 KLHL13Q9P2N7 655 aa11.78□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 WSB1Q9Y6I7 421 aa11.78□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 BTBD17A6NE02 478 aa11.77□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 ANKUB1A6NFN9 424 aa11.77□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 CCDC85CA6NKD9 419 aa11.77□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 TSTD3H0UI37 97 aa11.77□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 SSSCA1O60232 199 aa11.77□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 EPHA1P21709 976 aa11.77□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 SPCS3P61009 180 aa11.77□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 ICAM4Q14773 271 aa11.77□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM123Q8N131 208 aa11.77□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 OR8G5Q8NG78 346 aa11.77□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 TP53RKQ96S44 253 aa11.77□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF160Q9HCG1 818 aa11.77□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 PLSCR2Q9NRY7 297 aa11.77□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 ALKBH4Q9NXW9 302 aa11.77□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 UNC13CQ8NB66 2214 aa11.77□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa11.77□□□□□ -0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 NKX2-6A6NCS4 301 aa11.77□□□□□ -0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 HYAL1Q12794 435 aa11.77□□□□□ -0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 GNMTQ14749 295 aa11.77□□□□□ -0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 BEND4Q6ZU67 534 aa11.77□□□□□ -0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 OR2C3Q8N628 320 aa11.77□□□□□ -0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF441Q8N8Z8 693 aa11.77□□□□□ -0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 OR10AD1Q8NGE0 317 aa11.77□□□□□ -0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 SVIPQ8NHG7 77 aa11.77□□□□□ -0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 M1APQ8TC57 530 aa11.77□□□□□ -0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 C18orf12Q96KH6 178 aa11.77□□□□□ -0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa11.77□□□□□ -0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 NPIPB13A6NJU9 1138 aa11.76□□□□□ -0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 NPIPB4C9JG80 1138 aa11.76□□□□□ -0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 MKRN2OSH3BPM6 223 aa11.76□□□□□ -0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 CA11O75493 328 aa11.76□□□□□ -0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 FBLP22087 321 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 CCL1P22362 96 aa11.76□□□□□ -0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 CEACAM6P40199 344 aa11.76□□□□□ -0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 GLIPR1P48060 266 aa11.76□□□□□ -0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 PPA1Q15181 289 aa11.76□□□□□ -0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa11.76□□□□□ -0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 FBXL14Q8N1E6 418 aa11.76□□□□□ -0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 OR2AE1Q8NHA4 323 aa11.76□□□□□ -0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 LMX1AQ8TE12 382 aa11.76□□□□□ -0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 MISP3Q96FF7 219 aa11.76□□□□□ -0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms