RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 IL17BQ9UHF5 180 aa6.77□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 A0A1W2PNV4 684 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 OR2M5A3KFT3 312 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 C9orf172C9J069 976 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 M0QYG6 137 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 XRCC3O43542 346 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 NME2P1O60361 137 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 HAAOP46952 286 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 IFITM2Q01629 132 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 COX19Q49B96 90 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 OR2M3Q8NG83 312 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 OR13D1Q8NGV5 346 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 CMBLQ96DG6 245 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 AKR1E2Q96JD6 320 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 CHRDL1Q9BU40 450 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 ADAMTS20P59510 1910 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 SEC16AO15027 2179 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 A0A1W2PNR3 127 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 ABCD4O14678 606 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 CRYBA1P05813 215 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 ACKR3P25106 362 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 MST1P26927 711 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 P2RY6Q15077 328 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 PLPPR5Q32ZL2 321 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 TMEM65Q6PI78 240 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 IGF2-ASQ6U949 168 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 GCNT2Q8N0V5 402 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 ZNF519Q8TB69 540 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 RAB24Q969Q5 203 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 IMMP1LQ96LU5 166 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 SUCNR1Q9BXA5 334 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 TTTY12Q9BZ98 90 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 BARHL1Q9BZE3 327 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 LIPT2A6NK58 231 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 MPTX1A8MV57 137 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 DOK2O60496 412 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 QDPRP09417 244 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 RPL29P47914 159 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 TLE1Q04724 770 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 CATR1Q13166 79 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 LINC01590Q5TEZ4 76 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 DEGS2Q6QHC5 323 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 ARRDC1Q8N5I2 433 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 OTOSQ8NHW6 89 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 ASB10Q8WXI3 467 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 NTNG2Q96CW9 530 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 SELENOIQ9C0D9 397 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 METTL9Q9H1A3 318 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 PITPNC1Q9UKF7 332 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 OR52A1Q9UKL2 312 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 IGHV3-9P01782 118 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 COX6B1P14854 86 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 BMP5P22003 454 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 PLA2G5P39877 138 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 SULT1A2P50226 295 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 DLK1P80370 383 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 DOC2BQ14184 412 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 ETFDHQ16134 617 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 LINC00303Q3SY05 128 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 TMEM91Q6ZNR0 172 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 MTURNQ8N3F0 131 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 ZNF511Q8NB15 262 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 ZNF596Q8TC21 504 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 FAHD2AQ96GK7 314 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 FAM210BQ96KR6 192 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 GPR173Q9NS66 373 aa6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 MFNGO00587 321 aa6.75□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 CD3EP07766 207 aa6.75□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 TUSC1Q2TAM9 212 aa6.75□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa6.75□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 SLC22A6Q4U2R8 563 aa6.75□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 FADS6Q8N9I5 356 aa6.75□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 SMIM7Q9BQ49 75 aa6.75□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 LAMP3Q9UQV4 416 aa6.75□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 ZFP92A6NM28 416 aa6.75□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 ERVH48-1M5A8F1 160 aa6.75□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 CCL3P10147 92 aa6.75□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 TNFRSF1AP19438 455 aa6.75□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 ALOX5APP20292 161 aa6.75□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 EPHA1P21709 976 aa6.75□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.75□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 FDX2Q6P4F2 183 aa6.75□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 NOXO1Q8NFA2 376 aa6.75□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 OR8B4Q96RC9 309 aa6.75□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 NECAP2Q9NVZ3 263 aa6.75□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa6.75□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 V9GYH0 126 aa6.75□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 CCSO14618 274 aa6.75□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 ZNF345Q14585 488 aa6.75□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 TMEM128Q5BJH2 165 aa6.75□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 OR2B11Q5JQS5 317 aa6.75□□□□□ -1.33
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