RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 IGF2-ASQ6U949 168 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 C1orf174Q8IYL3 243 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 ELOVL3Q9HB03 270 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 SPHK2Q9NRA0 654 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 GPR132Q9UNW8 380 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 G3V4G9 280 aa4.97□□□□□ -1.61
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PTPRC-209ENST00000442510 ADCYAP1P18509 176 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 CD1CP29017 333 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF83P51522 516 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 P2RY6Q15077 328 aa4.97□□□□□ -1.61
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PTPRC-209ENST00000442510 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa4.97□□□□□ -1.61
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PTPRC-209ENST00000442510 OR13H1Q8NG92 308 aa4.97□□□□□ -1.61
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PTPRC-209ENST00000442510 GPR150Q8NGU9 434 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 SGMS2Q8NHU3 365 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 SPATA33Q96N06 139 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
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PTPRC-209ENST00000442510 POPDC3Q9HBV1 291 aa4.97□□□□□ -1.61
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PTPRC-209ENST00000442510 NFAT5O94916 1531 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 CDC14CA4D256 554 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 FGF16O43320 207 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 SYNGR1O43759 233 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 MPIG6BO95866 241 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 HLA-DRB1P01911 266 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 ARSAP15289 507 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 RELBQ01201 579 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 FUT7Q11130 342 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 RGNQ15493 299 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 SAMD5Q5TGI4 173 aa4.97□□□□□ -1.61
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PTPRC-209ENST00000442510 C4orf19Q8IY42 314 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 SLC25A28Q96A46 364 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 IMMP2LQ96T52 175 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 B4GALT6Q9UBX8 382 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 NUMA1Q14980 2115 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa4.96□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 A0A0U1RQS6 177 aa4.96□□□□□ -1.61
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PTPRC-209ENST00000442510 ZNF737O75373 536 aa4.96□□□□□ -1.61
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PTPRC-209ENST00000442510 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM91Q6ZNR0 172 aa4.96□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 CLEC14AQ86T13 490 aa4.96□□□□□ -1.61
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PTPRC-209ENST00000442510 LRRC29Q8WV35 223 aa4.96□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 SMIM8Q96KF7 97 aa4.96□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 MRGPRX3Q96LB0 322 aa4.96□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 FRG2BQ96QU4 278 aa4.96□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 GREM2Q9H772 168 aa4.96□□□□□ -1.61
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PTPRC-209ENST00000442510 WNT16Q9UBV4 365 aa4.96□□□□□ -1.61
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PTPRC-209ENST00000442510 CD300LBA8K4G0 201 aa4.96□□□□□ -1.62
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PTPRC-209ENST00000442510 IL11RAQ14626 422 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 CDKN3Q16667 212 aa4.96□□□□□ -1.62
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PTPRC-209ENST00000442510 NUS1Q96E22 293 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 VN1R3Q9BXE9 311 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 DECR2Q9NUI1 292 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 INSL5Q9Y5Q6 135 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa4.96□□□□□ -1.62
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PTPRC-209ENST00000442510 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 UPK1AO00322 258 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 EFEMP2O95967 443 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 SBK3P0C264 359 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 TNFRSF1AP19438 455 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 NMUP48645 174 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 GFRA1P56159 465 aa4.96□□□□□ -1.62
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