RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 ACTA2P62736 377 aa16.92■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 ACTG2P63267 376 aa16.92■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 ACTC1P68032 377 aa16.92■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 ACTA1P68133 377 aa16.92■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 SSX2Q16385 188 aa16.92■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 BEAN1Q3B7T3 259 aa16.92■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa16.92■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa16.92■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 OR2G2Q8NGZ5 317 aa16.92■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 SPSB1Q96BD6 273 aa16.92■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 MBOAT4Q96T53 435 aa16.92■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 SESN1Q9Y6P5 492 aa16.92■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa16.91■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 J3QRE1 110 aa16.91■□□□□ 0.3
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LIMS1-208ENST00000428064 VSIG10L2P0DP72 767 aa16.91■□□□□ 0.3
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LIMS1-208ENST00000428064 OR12D2P58182 307 aa16.91■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 EDDM3AQ14507 147 aa16.91■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 GRK1Q15835 563 aa16.91■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 TP53I3Q53FA7 332 aa16.91■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 SLC25A30Q5SVS4 291 aa16.91■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 SAMD5Q5TGI4 173 aa16.91■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 FAM58AQ8N1B3 248 aa16.91■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 C11orf44Q8N8P7 122 aa16.91■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 OR52N4Q8NGI2 321 aa16.91■□□□□ 0.3
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LIMS1-208ENST00000428064 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa16.9■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 PSPNO60542 156 aa16.9■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 ENTPD6O75354 484 aa16.9■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 FBXO24O75426 580 aa16.9■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 ATF1P18846 271 aa16.9■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 NPBWR2P48146 333 aa16.9■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 RAB13P51153 203 aa16.9■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 CCR9P51686 369 aa16.9■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 PLA1AQ53H76 456 aa16.9■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 RDH10Q8IZV5 341 aa16.9■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF676Q8N7Q3 588 aa16.9■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 HRASLS5Q96KN8 279 aa16.9■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 PRSS22Q9GZN4 317 aa16.9■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 WNT10AQ9GZT5 417 aa16.9■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM133Q9H2Q1 129 aa16.9■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 RHOFQ9HBH0 211 aa16.9■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 FRRS1LQ9P0K9 344 aa16.9■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 GLS2Q9UI32 602 aa16.9■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
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LIMS1-208ENST00000428064 G3V4G9 280 aa16.89■□□□□ 0.29
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LIMS1-208ENST00000428064 BCL3P20749 454 aa16.89■□□□□ 0.29
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LIMS1-208ENST00000428064 MTCP1P56278 107 aa16.89■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
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LIMS1-208ENST00000428064 NDUFA11Q86Y39 141 aa16.89■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 OPALINQ96PE5 141 aa16.89■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 CLEC7AQ9BXN2 247 aa16.89■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 CHST6Q9GZX3 395 aa16.89■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 HMG20AQ9NP66 347 aa16.89■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 IMPAD1Q9NX62 359 aa16.89■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 FAM90A22PA8MWA6 464 aa16.88■□□□□ 0.29
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LIMS1-208ENST00000428064 F2RL2O00254 374 aa16.88■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 SLC16A6O15403 523 aa16.88■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 INMTO95050 263 aa16.88■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 ALPLP05186 524 aa16.88■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF20P17024 532 aa16.88■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 PRKACAP17612 351 aa16.88■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 OR3A1P47881 315 aa16.88■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 POU3F4P49335 361 aa16.88■□□□□ 0.29
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LIMS1-208ENST00000428064 PDZK1IP1Q13113 114 aa16.88■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 TPRX1Q8N7U7 411 aa16.88■□□□□ 0.29
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LIMS1-208ENST00000428064 FGGYQ96C11 551 aa16.88■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 PLXNB1O43157 2135 aa16.88■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 SAC3D1A6NKF1 404 aa16.87■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 CIB2O75838 187 aa16.87■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 ALDOBP05062 364 aa16.87■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 LMO1P25800 156 aa16.87■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 IL18R1Q13478 541 aa16.87■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 C16orf82Q7Z2V1 217 aa16.87■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 OR4P4Q8NGL7 312 aa16.87■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 RNFT2Q96EX2 444 aa16.87■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 COMMD4Q9H0A8 199 aa16.87■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa16.87■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 HHLA2Q9UM44 414 aa16.87■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 DAPL1A0PJW8 107 aa16.86■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 FUOMA2VDF0 154 aa16.86■□□□□ 0.29
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