RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427220.5

TTLL3-210, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTLL3, Length 3,233 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-210ENST00000427220 OR2T2Q6IF00 324 aa17■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 KCNE4Q8WWG9 221 aa17■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 PIK3IP1Q96FE7 263 aa17■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 TOR1AO14656 332 aa17■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 FCGR3AP08637 254 aa17■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 EPHA1P21709 976 aa17■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF616Q08AN1 781 aa17■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 HES3Q5TGS1 186 aa17■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 SH2D2AQ9NP31 389 aa17■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 AUP1Q9Y679 476 aa17■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa16.99■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 A0A1B0GW55 424 aa16.99■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 K7EPK0 472 aa16.99■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 C1QL1O75973 258 aa16.99■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 WISP2O76076 250 aa16.99■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 DUX4L2P0CJ85 424 aa16.99■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 DUX4L3P0CJ86 424 aa16.99■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 DUX4L4P0CJ87 422 aa16.99■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 DUX4L5P0CJ88 424 aa16.99■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 DUX4L6P0CJ89 424 aa16.99■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 DUX4L7P0CJ90 424 aa16.99■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 FOXO1Q12778 655 aa16.99■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 CLINT1Q14677 625 aa16.99■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 GUCA2BQ16661 112 aa16.99■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa16.99■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 C2orf50Q96LR7 162 aa16.99■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 B4GALT7Q9UBV7 327 aa16.99■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 DUX4Q9UBX2 424 aa16.99■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 CST2P09228 141 aa16.99■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 CBX5P45973 191 aa16.99■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 ARG2P78540 354 aa16.99■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 ACTBL2Q562R1 376 aa16.99■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 SYNGR1O43759 233 aa16.98■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 CCL11P51671 97 aa16.98■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 PRDX4Q13162 271 aa16.98■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 APH1AQ96BI3 265 aa16.98■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa16.98■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 PCP4L1A6NKN8 68 aa16.98■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 ONECUT2O95948 504 aa16.98■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 MT-CO3P00414 261 aa16.98■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 FGF2P09038 288 aa16.98■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 TBPP20226 339 aa16.98■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 AADACP22760 399 aa16.98■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 FAM89BQ8N5H3 189 aa16.98■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa16.98■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 SLC25A32Q9H2D1 315 aa16.98■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa16.98■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 OR6C6A6NF89 314 aa16.98■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 KRBOX1C9JBD0 128 aa16.98■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 PRKACAP17612 351 aa16.98■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 MEOX1P50221 254 aa16.98■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 CAV2P51636 162 aa16.98■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 CYCSP99999 105 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa16.98■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 BCO1Q9HAY6 547 aa16.98■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 FZR1Q9UM11 496 aa16.98■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 ACTL6AO96019 429 aa16.97■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 PRH1P02810 166 aa16.97■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 SLC25A4P12235 298 aa16.97■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 CA6P23280 308 aa16.97■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 RPL12P30050 165 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 FHITP49789 147 aa16.97■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 CBLN2Q8IUK8 224 aa16.97■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 MARC2Q969Z3 335 aa16.97■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 NECAP2Q9NVZ3 263 aa16.97■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 C1orf123Q9NWV4 160 aa16.97■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 ACACAQ13085 2346 aa16.97■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 NME2P1O60361 137 aa16.97■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 SCTP09683 121 aa16.97■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 GLP1RP43220 463 aa16.97■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 EXTL1Q92935 676 aa16.97■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 TAF9BQ9HBM6 251 aa16.97■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 ABI3Q9P2A4 366 aa16.97■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa16.96■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 ABCD4O14678 606 aa16.96■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 GP1BAP07359 652 aa16.96■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF44P15621 663 aa16.96■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 FAM189A2Q15884 450 aa16.96■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 TMEM217Q8N7C4 229 aa16.96■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa16.96■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 OR52M1Q8NGK5 317 aa16.96■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 SPSB1Q96BD6 273 aa16.96■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 FAM173AQ9BQD7 235 aa16.96■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 GTF3C1Q12789 2109 aa16.96■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 A8MXK9 166 aa16.96■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa16.96■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 PCBD1P61457 104 aa16.96■□□□□ 0.31
TTLL3-210ENST00000427220 FBXL17Q9UF56 701 aa16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 110.4 ms