RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380221.7

TRAPPC10-202, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-202ENST00000380221 SCPEP1Q9HB40 452 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 NLKQ9UBE8 527 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 LAMP3Q9UQV4 416 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 LPLP06858 475 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 GLCCI1Q86VQ1 547 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM89BQ8N5H3 189 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 DUSP18Q8NEJ0 188 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 TM2D1Q9BX74 207 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 DECR2Q9NUI1 292 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 MEIS3P1A6NDR6 274 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 AKR7A2O43488 359 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 GNB3P16520 340 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 BTCP35070 178 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 BCAP31P51572 246 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 TLE4Q04727 773 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM209AQ5JX71 171 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 DTX2Q86UW9 622 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 GCM1Q9NP62 436 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 DCHS2Q6V1P9 2916 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 MT-ND4P03905 459 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 GTF2F2P13984 249 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC6A1P30531 599 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 PMELP40967 661 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 GATA4P43694 442 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 GMFBP60983 142 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 RAB3CQ96E17 227 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 TREM2Q9NZC2 230 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 MELTFP08582 738 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 PGA5P0DJD9 388 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 CPT2P23786 658 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 PCGF3Q3KNV8 242 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 PLAC9Q5JTB6 97 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 PLET1Q6UQ28 207 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 RTN4RL2Q86UN3 420 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 OSR2Q8N2R0 312 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 FN3KRPQ9HA64 309 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 SAP30LQ9HAJ7 183 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 HRASLSQ9HDD0 168 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 PFDN1O60925 122 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 PPOXP50336 477 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM50BP56557 158 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 TESK1Q15569 626 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 Q8NFD4 153 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 Q96M66 194 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 EGLN1Q9GZT9 426 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 TAS2R8Q9NYW2 309 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 CSF1P09603 554 aa23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 TNFRSF1AP19438 455 aa23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 PIGYQ3MUY2 71 aa23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 ELP2Q6IA86 826 aa23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 NRIP2Q9BQI9 281 aa23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 IL36RNQ9UBH0 155 aa23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 SNU13P55769 128 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 ACTBP60709 375 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 ERVK11-1P61568 191 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 ACTG1P63261 375 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 PLA1AQ53H76 456 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 POC1AQ8NBT0 407 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 LRRC29Q8WV35 223 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 CACNG6Q9BXT2 260 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 ST3GAL6Q9Y274 331 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRKACAP17612 351 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 FGF12P61328 243 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 CADM3Q8N126 398 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 WDR13Q9H1Z4 485 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 WNT9BO14905 357 aa23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 HPXP02790 462 aa23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 GABRR1P24046 479 aa23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM58AQ8N1B3 248 aa23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 DPAGT1Q9H3H5 408 aa23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 KCNK7Q9Y2U2 307 aa23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 NAP1L6A6NFF2 107 aa23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 NXPH2O95156 264 aa23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 FCER2P06734 321 aa23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 GIFP27352 417 aa23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 TAF9Q16594 264 aa23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 OLFML2AQ68BL7 652 aa23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa23.35■■□□□ 1.33
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