RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368215.7

PTPRK-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 4,651 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-206ENST00000368215 FAM122CQ6P4D5 195 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 SKA3Q8IX90 412 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 SLC38A6Q8IZM9 456 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 DEFB108BQ8NET1 73 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 SLC30A7Q8NEW0 376 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 EFNA2O43921 213 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 BVESQ8NE79 360 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 ZNF488Q96MN9 340 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 B3GAT1Q9P2W7 334 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 TNFSF18Q9UNG2 199 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 NBASA2RRP1 2371 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 FAM24AA6NFZ4 105 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 LINC01387J3KSC0 135 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 GPR31O00270 319 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 SH2D1BO14796 132 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 H2AFB1P0C5Y9 115 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 CD37P11049 281 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 BCL3P20749 454 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 MECP2P51608 486 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 TMEM33P57088 247 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 STPG1Q5TH74 334 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 SSX9Q7RTT3 188 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 LYZL2Q7Z4W2 148 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 HOGA1Q86XE5 327 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 ZNF441Q8N8Z8 693 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 FBXO17Q96EF6 278 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 AKR1E2Q96JD6 320 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 IER2Q9BTL4 223 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 ZNF391Q9UJN7 358 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 POLEQ07864 2286 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 A0A0G2JMM0 328 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 A0A1W2PPB8 328 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 A0A1W2PRS3 328 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 KIR3DP1A8MWS1 328 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 ADAM20O43506 726 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 GLAP06280 429 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 RPS16P62249 146 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 TESK1Q15569 626 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 ADAM5Q6NVV9 412 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 LCN15Q6UWW0 184 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 FAM58AQ8N1B3 248 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 C17orf78Q8N4C9 275 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 PIPOXQ9P0Z9 390 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 A0A0U1RQK1 487 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 A0A0U1RQV5 110 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 M0R296 226 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 TXNL1O43396 289 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 HBG1P69891 147 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 HBG2P69892 147 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 ZXDAP98168 799 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 TSC22D1Q15714 1073 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 FAM209AQ5JX71 171 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 CDCP2Q5VXM1 449 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 THNSL2Q86YJ6 484 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 TMEM123Q8N131 208 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 RFESDQ8TAC1 157 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 RNF212BA8MTL3 300 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 TMEM14DPA8MWL7 114 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 TERTO14746 1132 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 OR2A4O95047 310 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 IFNA4P05014 189 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 ZNF17P17021 662 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 NFYBP25208 207 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 F2RL1P55085 397 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 ZADH2Q8N4Q0 377 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 OR2A7Q96R45 310 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 SLC2A9Q9NRM0 540 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 OR5AC2Q9NZP5 309 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 ZNF724A8MTY0 619 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 UMAD1C9J7I0 102 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 CST4P01036 141 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 PTAFRP25105 342 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 TLE4Q04727 773 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 BAXQ07812 192 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 TGIF1Q15583 401 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 MIDNQ504T8 468 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 AVPI1Q5T686 147 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 OR11L1Q8NGX0 322 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 GPHA2Q96T91 129 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 NMES1Q9C002 83 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 SLC39A9Q9NUM3 307 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 ZNF319Q9P2F9 582 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 GPR132Q9UNW8 380 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 IFNA10P01566 189 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 ALDH3B1P43353 468 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 SOX8P57073 446 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRK-206ENST00000368215 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms