RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 CXXC4Q9H2H0 198 aa13.03□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 UFSP2Q9NUQ7 469 aa13.03□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 HSPB6O14558 160 aa13.02□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 PDCD6O75340 191 aa13.02□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 CCNKO75909 580 aa13.02□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM108Q6UXF1 575 aa13.02□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 Q6ZPA2 131 aa13.02□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 C5orf24Q7Z6I8 188 aa13.02□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 OR13C8Q8NGS7 320 aa13.02□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 LINC01560Q8TB33 94 aa13.02□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 MRGPRFQ96AM1 343 aa13.02□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF442Q9H7R0 627 aa13.02□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa13.02□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 HS3ST1O14792 307 aa13.02□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 PEX14O75381 377 aa13.02□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 VSIG10L2P0DP72 767 aa13.02□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 AMY2BP19961 511 aa13.02□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 CHRNB4P30926 498 aa13.02□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 ASCL1P50553 236 aa13.02□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 IKZF1Q13422 519 aa13.02□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 SLC22A25Q6T423 547 aa13.02□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 PPP1R14BQ96C90 147 aa13.02□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 SEC22CQ9BRL7 303 aa13.02□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 TAAR3PQ9P1P4 343 aa13.02□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 CACNA1BQ00975 2339 aa13.01□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa13.01□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM210A6NLX4 147 aa13.01□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 DISC1C4P0D8 188 aa13.01□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 WNT9BO14905 357 aa13.01□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 CA11O75493 328 aa13.01□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 RLN1P04808 185 aa13.01□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 PTAFRP25105 342 aa13.01□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 CBX5P45973 191 aa13.01□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 RAG2P55895 527 aa13.01□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 ERVK11-1P61568 191 aa13.01□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 ARL6IP1Q15041 203 aa13.01□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 C11orf91Q3C1V1 193 aa13.01□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 NHLRC3Q5JS37 347 aa13.01□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 OR6F1Q8NGZ6 308 aa13.01□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 PRR7Q8TB68 274 aa13.01□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 ST6GAL2Q96JF0 529 aa13.01□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 WDR13Q9H1Z4 485 aa13.01□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa13.01□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 CACNA1DQ01668 2161 aa13.01□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa13□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 A0A1B0GWJ7 208 aa13□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 C7orf66A4D0T2 115 aa13□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 SPRY3O43610 288 aa13□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 PGA5P0DJD9 388 aa13□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 MEF2DQ14814 521 aa13□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 OR52B4Q8NGK2 314 aa13□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 LILRB4Q8NHJ6 448 aa13□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 CAPSLQ8WWF8 208 aa13□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 OR51J1Q9H342 316 aa13□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 COQ3Q9NZJ6 369 aa13□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa13□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 ATP23Q9Y6H3 246 aa13□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 IGSF10Q6WRI0 2623 aa13□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 TRAV24A0A0B4J272 114 aa12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 FAM90A10PA6NDY2 464 aa12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 FAM90A18PA6NE21 464 aa12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 FAM90A16PA6NEW6 464 aa12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 FAM90A7PA6NKC0 464 aa12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 A6NLC8 198 aa12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 OR2AT4A6NND4 320 aa12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 FAM90A22PA8MWA6 464 aa12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 FAM90A12PA8MX19 464 aa12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 FAM90A15PP0C7V4 464 aa12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 FAM90A13PP0C7W8 464 aa12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 FAM90A14PP0C7W9 464 aa12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 FAM90A24PP0C7X0 464 aa12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 CD83Q01151 205 aa12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 FCN2Q15485 313 aa12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 ADAM5Q6NVV9 412 aa12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 Q6P435 159 aa12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 SUMF2Q8NBJ7 301 aa12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 RDH5Q92781 318 aa12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 NEUROG1Q92886 237 aa12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 NRIP2Q9BQI9 281 aa12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 CA10Q9NS85 328 aa12.99□□□□□ -0.33
CASQ1-201ENST00000368078 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms