RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 TMEM252Q8N6L7 170 aa18.96■□□□□ 0.63
OPN3-201ENST00000366554 OR5C1Q8NGR4 320 aa18.96■□□□□ 0.63
OPN3-201ENST00000366554 MOB1AQ9H8S9 216 aa18.96■□□□□ 0.63
OPN3-201ENST00000366554 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa18.96■□□□□ 0.63
OPN3-201ENST00000366554 GLRX2Q9NS18 164 aa18.96■□□□□ 0.63
OPN3-201ENST00000366554 GPR173Q9NS66 373 aa18.96■□□□□ 0.63
OPN3-201ENST00000366554 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
OPN3-201ENST00000366554 SEMA5BQ9P283 1151 aa18.96■□□□□ 0.63
OPN3-201ENST00000366554 GNG13Q9P2W3 67 aa18.96■□□□□ 0.63
OPN3-201ENST00000366554 PCNX3Q9H6A9 2034 aa18.96■□□□□ 0.63
OPN3-201ENST00000366554 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
OPN3-201ENST00000366554 CST2P09228 141 aa18.96■□□□□ 0.63
OPN3-201ENST00000366554 GP1BBP13224 206 aa18.96■□□□□ 0.63
OPN3-201ENST00000366554 IL11P20809 199 aa18.96■□□□□ 0.63
OPN3-201ENST00000366554 DEFB110Q30KQ9 67 aa18.96■□□□□ 0.63
OPN3-201ENST00000366554 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa18.96■□□□□ 0.63
OPN3-201ENST00000366554 ZNF248Q8NDW4 579 aa18.96■□□□□ 0.63
OPN3-201ENST00000366554 OR8B12Q8NGG6 310 aa18.96■□□□□ 0.63
OPN3-201ENST00000366554 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
OPN3-201ENST00000366554 FAM60AQ9NP50 221 aa18.96■□□□□ 0.63
OPN3-201ENST00000366554 SLC2A9Q9NRM0 540 aa18.96■□□□□ 0.63
OPN3-201ENST00000366554 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
OPN3-201ENST00000366554 A0A0J9YY10 115 aa18.95■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 MS4A18H0YCH9 400 aa18.95■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 TMEM225BP0DP42 221 aa18.95■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 WASP42768 502 aa18.95■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 LBX1P52954 281 aa18.95■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 DEFB103AP81534 67 aa18.95■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 CLN3Q13286 438 aa18.95■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 KISS1Q15726 138 aa18.95■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 MS4A18Q3C1V0 323 aa18.95■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 C1orf189Q5VU69 101 aa18.95■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 BTNL3Q6UXE8 466 aa18.95■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 ZNF321PQ8N8H1 164 aa18.95■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 ZNF205O95201 554 aa18.95■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 PHLDA2Q53GA4 152 aa18.95■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 CDCP2Q5VXM1 449 aa18.95■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 NCR3LG1Q68D85 454 aa18.95■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 ODF3L1Q8IXM7 274 aa18.95■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 FAM185AQ8N0U4 392 aa18.95■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 TMEM170AQ8WVE7 144 aa18.95■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 VWCEQ96DN2 955 aa18.95■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 MMP9P14780 707 aa18.94■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 PGCP20142 388 aa18.94■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 PRR22Q8IZ63 422 aa18.94■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 SLC38A9Q8NBW4 561 aa18.94■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 OR5L1Q8NGL2 311 aa18.94■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 PPP5D1E7EU14 171 aa18.94■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 RPL29P47914 159 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 ELLP55199 621 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 ARMC6Q6NXE6 501 aa18.94■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 B4E171 279 aa18.93■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 NPIPA5E9PKD4 350 aa18.93■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 ONECUT2O95948 504 aa18.93■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 BCL2P10415 239 aa18.93■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 GZMHP20718 246 aa18.93■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 CCL1P22362 96 aa18.93■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 TSPAN7P41732 249 aa18.93■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 PPP1CAP62136 330 aa18.93■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa18.93■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 NPIPA1Q9UND3 350 aa18.93■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 LAMP3Q9UQV4 416 aa18.93■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa18.93■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 THEGLP0DJG4 465 aa18.93■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 DCAF7P61962 342 aa18.93■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 MPV17LQ2QL34 196 aa18.93■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 SLC46A1Q96NT5 459 aa18.93■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 SLC31A1O15431 190 aa18.92■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 CDS2O95674 445 aa18.92■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 DYNLT3P51808 116 aa18.92■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 THEM4Q5T1C6 240 aa18.92■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 D2HGDHQ8N465 521 aa18.92■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 OR51G1Q8NGK1 321 aa18.92■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa18.92■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 HRASLS2Q9NWW9 162 aa18.92■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 MED29Q9NX70 200 aa18.92■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 LRFN1Q9P244 771 aa18.92■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 DMRTA1Q5VZB9 504 aa18.92■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 FAAP24Q9BTP7 215 aa18.92■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 CHST11Q9NPF2 352 aa18.92■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 NECAP2Q9NVZ3 263 aa18.92■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 FKBP11Q9NYL4 201 aa18.92■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 NKX2-6A6NCS4 301 aa18.91■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 C17orf105B2RV13 164 aa18.91■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 JMJD7P0C870 316 aa18.91■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 GNG10P50151 68 aa18.91■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 DAP3P51398 398 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
OPN3-201ENST00000366554 FXYD4P59646 89 aa18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms