RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340958.3

CLDN4-201, Transcript of claudin 4, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN4, Length 1,831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN4-201ENST00000340958 PLET1Q6UQ28 207 aa14.72□□□□□ -0.05
CLDN4-201ENST00000340958 RTN4RL2Q86UN3 420 aa14.72□□□□□ -0.05
CLDN4-201ENST00000340958 RNF115Q9Y4L5 304 aa14.72□□□□□ -0.05
CLDN4-201ENST00000340958 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa14.71□□□□□ -0.05
CLDN4-201ENST00000340958 SERPINF1P36955 418 aa14.71□□□□□ -0.05
CLDN4-201ENST00000340958 TAS2R19P59542 299 aa14.71□□□□□ -0.05
CLDN4-201ENST00000340958 TFF3Q07654 80 aa14.71□□□□□ -0.05
CLDN4-201ENST00000340958 IKZF1Q13422 519 aa14.71□□□□□ -0.05
CLDN4-201ENST00000340958 ADIPOQQ15848 244 aa14.71□□□□□ -0.05
CLDN4-201ENST00000340958 DNM1P46Q6ZS02 220 aa14.71□□□□□ -0.05
CLDN4-201ENST00000340958 PIK3IP1Q96FE7 263 aa14.71□□□□□ -0.05
CLDN4-201ENST00000340958 RHOFQ9HBH0 211 aa14.71□□□□□ -0.05
CLDN4-201ENST00000340958 HRASLSQ9HDD0 168 aa14.71□□□□□ -0.05
CLDN4-201ENST00000340958 C1orf123Q9NWV4 160 aa14.71□□□□□ -0.05
CLDN4-201ENST00000340958 NLKQ9UBE8 527 aa14.71□□□□□ -0.05
CLDN4-201ENST00000340958 KCNK7Q9Y2U2 307 aa14.71□□□□□ -0.05
CLDN4-201ENST00000340958 SHISA9B4DS77 424 aa14.71□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 HLA-DMAP28067 261 aa14.71□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 DUSP1P28562 367 aa14.71□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 BRICD5Q6PL45 260 aa14.71□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 ZNF826PQ6ZT77 177 aa14.71□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 OR2V2Q96R30 315 aa14.71□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 FAAP24Q9BTP7 215 aa14.71□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 MMP28Q9H239 520 aa14.71□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 DPAGT1Q9H3H5 408 aa14.71□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 HSF4Q9ULV5 492 aa14.71□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 CADP27708 2225 aa14.7□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa14.7□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 FAM90A10PA6NDY2 464 aa14.7□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 FAM90A18PA6NE21 464 aa14.7□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 FAM90A16PA6NEW6 464 aa14.7□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 NAP1L6A6NFF2 107 aa14.7□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa14.7□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa14.7□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 FAM90A7PA6NKC0 464 aa14.7□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 FAM90A22PA8MWA6 464 aa14.7□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 FAM90A12PA8MX19 464 aa14.7□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa14.7□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa14.7□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 PRSS44E7EML9 344 aa14.7□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 H3BUI4 141 aa14.7□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 PDCD6O75340 191 aa14.7□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 FAM90A15PP0C7V4 464 aa14.7□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 FAM90A13PP0C7W8 464 aa14.7□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 FAM90A14PP0C7W9 464 aa14.7□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 FAM90A24PP0C7X0 464 aa14.7□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 AKAIN1P0CW23 69 aa14.7□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 FUT3P21217 361 aa14.7□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 KIR2DL3P43628 341 aa14.7□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 CBX5P45973 191 aa14.7□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 MPPED2Q15777 294 aa14.7□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 Q8NFD4 153 aa14.7□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 NEK7Q8TDX7 302 aa14.7□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 POM121Q96HA1 1249 aa14.7□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa14.7□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa14.7□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 UBE2QL1A1L167 161 aa14.69□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 PGA5P0DJD9 388 aa14.69□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 GIFP27352 417 aa14.69□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 CD200P41217 278 aa14.69□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 MPV17LQ2QL34 196 aa14.69□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa14.69□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 LINC00596Q86U02 117 aa14.69□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 GVQW1Q8N7I0 195 aa14.69□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 CHAC2Q8WUX2 184 aa14.69□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 HS3ST6Q96QI5 342 aa14.69□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 FN3KRPQ9HA64 309 aa14.69□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 ZNF581Q9P0T4 197 aa14.69□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 IL36RNQ9UBH0 155 aa14.69□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 A0A1B0GWJ7 208 aa14.69□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 E7EQL1 145 aa14.69□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 CD3DP04234 171 aa14.69□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 ZNF44P15621 663 aa14.69□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 CHATP28329 748 aa14.69□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 NHLRC3Q5JS37 347 aa14.69□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 SIGIRRQ6IA17 410 aa14.69□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 FAAP20Q6NZ36 180 aa14.69□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 STEAP1BQ6NZ63 245 aa14.69□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 GLCCI1Q86VQ1 547 aa14.69□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 TMEM229BQ8NBD8 167 aa14.69□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 DEDD2Q8WXF8 326 aa14.69□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 ST8SIA4Q92187 359 aa14.69□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 NEUROG1Q92886 237 aa14.69□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 MEGF10Q96KG7 1140 aa14.69□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 NRIP2Q9BQI9 281 aa14.69□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 CACNG6Q9BXT2 260 aa14.69□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 SPACA1Q9HBV2 294 aa14.69□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 DYNLRB1Q9NP97 96 aa14.69□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
CLDN4-201ENST00000340958 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms