RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000280780.6

FAM53B-201, Transcript of family with sequence similarity 53 member B, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM53B, Length 1,568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM53B-201	ENST00000280780	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		18.76	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		18.76	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	GHRL	Q9UBU3	117 aa		18.76	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		18.76	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		18.76	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		18.76	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	WNT9B	O14905	357 aa		18.76	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	RP2	O75695	350 aa		18.76	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	18.76	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	LHB	P01229	141 aa		18.76	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	CFHR2	P36980	270 aa		18.76	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	EFNA4	P52798	201 aa		18.76	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	EFNB2	P52799	333 aa		18.76	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		18.76	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780		Q8N402	240 aa		18.76	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	POC1A	Q8NBT0	407 aa		18.76	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	SEH1L	Q96EE3	360 aa		18.76	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	18.76	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	IL36G	Q9NZH8	169 aa		18.76	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780		A0A0A6YYH2	397 aa		18.75	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780		A6NJ64	397 aa		18.75	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		18.75	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	18.75	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	18.75	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	CD99	P14209	185 aa		18.75	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	GMFB	P60983	142 aa		18.75	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	FAM201A	Q5SY85	155 aa		18.75	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	BIVM	Q86UB2	503 aa		18.75	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	OR8H2	Q8N162	312 aa		18.75	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		18.75	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	SETD6	Q8TBK2	473 aa		18.75	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		18.75	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	FAM46B	Q96A09	425 aa		18.75	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	SMR3A	Q99954	134 aa		18.75	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		18.75	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	RAB22A	Q9UL26	194 aa		18.75	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		18.74	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	SRRM5	B3KS81	715 aa		18.74	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	XRCC3	O43542	346 aa		18.74	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	18.74	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	SERPINA2	P20848	420 aa		18.74	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	CDK2	P24941	298 aa		18.74	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	RSU1	Q15404	277 aa		18.74	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		18.74	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780		Q8NFD4	153 aa		18.74	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	CCL17	Q92583	94 aa		18.74	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	METTL9	Q9H1A3	318 aa		18.74	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	HES4	Q9HCC6	221 aa		18.74	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		18.74	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	RNF7	Q9UBF6	113 aa		18.74	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780		A0A1W2PQ09	198 aa		18.73	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		18.73	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780		H7C1Q1	480 aa		18.73	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	CYB5A	P00167	134 aa		18.73	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	DAO	P14920	347 aa		18.73	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		18.73	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		18.73	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	BANF2	Q9H503	90 aa		18.73	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	18.73	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	ZFHX3	Q15911	3703 aa		18.73	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	TMEM178B	H3BS89	294 aa		18.72	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	HTR3B	O95264	441 aa		18.72	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	18.72	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	SCN1B	Q07699	218 aa		18.72	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	OXA1L	Q15070	435 aa		18.72	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	HACD4	Q5VWC8	232 aa		18.72	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	ELP2	Q6IA86	826 aa		18.72	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	18.72	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		18.72	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	RDH5	Q92781	318 aa		18.72	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	TRIM63	Q969Q1	353 aa		18.72	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	S100A13	Q99584	98 aa		18.72	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	18.72	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	ZNF205	O95201	554 aa		18.72	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	CD80	P33681	288 aa		18.72	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	DEFA1	P59665	94 aa		18.72	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	DEFA3	P59666	94 aa		18.72	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	18.72	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	MADCAM1	Q13477	382 aa		18.72	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		18.72	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		18.72	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	18.72	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	18.72	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	OCEL1	Q9H607	264 aa		18.72	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	DIABLO	Q9NR28	239 aa		18.72	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		18.72	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	18.72	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	CR1	P17927	2039 aa		18.71	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	RNF223	E7ERA6	249 aa		18.71	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	18.71	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	MPIG6B	O95866	241 aa		18.71	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	MGMT	P16455	207 aa		18.71	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	TAS2R20	P59543	309 aa		18.71	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	FGF12	P61328	243 aa		18.71	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	ASAH1	Q13510	395 aa		18.71	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	HFE	Q30201	348 aa		18.71	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	PIGY	Q3MUY2	71 aa		18.71	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		18.71	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	DTX3	Q8N9I9	347 aa		18.71	■□□□□ 0.59

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms