RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 ZNF565Q8N9K5 539 aa12.96□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 FAM213BQ8TBF2 198 aa12.96□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 SPTSSAQ969W0 71 aa12.96□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 ANGPTL4Q9BY76 406 aa12.96□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 MIOXQ9UGB7 285 aa12.96□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 AP4M1O00189 453 aa12.96□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 SCRG1O75711 98 aa12.96□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 PNLIPP16233 465 aa12.96□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 CLINT1Q14677 625 aa12.96□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 CDCP2Q5VXM1 449 aa12.96□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 YPEL4Q96NS1 127 aa12.96□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 UCN2Q96RP3 112 aa12.96□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 SPSB2Q99619 263 aa12.96□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 RARRES2Q99969 163 aa12.96□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 A0A1B0GW64 132 aa12.95□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 TERTO14746 1132 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 MAS1LP35410 378 aa12.95□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 STARD6P59095 220 aa12.95□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 PIGYQ3MUY2 71 aa12.95□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 OR10AD1Q8NGE0 317 aa12.95□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 OR4D5Q8NGN0 318 aa12.95□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa12.95□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 RFNGQ9Y644 331 aa12.95□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 RPS23P62266 143 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 RAB1AP62820 205 aa12.95□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP12.95□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 LFNGQ8NES3 379 aa12.95□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 MOB3AQ96BX8 217 aa12.95□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 DEFB126Q9BYW3 111 aa12.95□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa12.94□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 NPIPA2E9PIF3 369 aa12.94□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 NPIPA3F8WFD2 350 aa12.94□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 PPIHO43447 177 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 IGKV1D-12P01611 117 aa12.94□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 CRYGSP22914 178 aa12.94□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 ASCL4Q6XD76 172 aa12.94□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 Q6ZPA2 131 aa12.94□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 SLC35G3Q8N808 338 aa12.94□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 NAXEQ8NCW5 288 aa12.94□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 BOD1Q96IK1 185 aa12.94□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 TP53RKQ96S44 253 aa12.94□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 SYT3Q9BQG1 590 aa12.94□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP12.94□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 GPR37O15354 613 aa12.94□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 CCL20P78556 96 aa12.94□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 ACER2Q5QJU3 275 aa12.94□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 C1QL4Q86Z23 238 aa12.94□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 EDARADDQ8WWZ3 215 aa12.94□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 GUCD1Q96NT3 240 aa12.94□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 C11orf1Q9H5F2 150 aa12.94□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 TMED3Q9Y3Q3 217 aa12.94□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 FAM24AA6NFZ4 105 aa12.93□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 OR2C1O95371 312 aa12.93□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 IGHV2-70P01814 119 aa12.93□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 S100PP25815 95 aa12.93□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 RBP2P50120 134 aa12.93□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 UCP3P55916 312 aa12.93□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 GNMTQ14749 295 aa12.93□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 SOHLH1Q5JUK2 328 aa12.93□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 NCMAPQ5T1S8 102 aa12.93□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 HEPN1Q6WQI6 88 aa12.93□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 SUMF2Q8NBJ7 301 aa12.93□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 NTNG2Q96CW9 530 aa12.93□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 BORCS8Q96FH0 119 aa12.93□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa12.93□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 ULBP2Q9BZM5 246 aa12.93□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 ZNF286AQ9HBT8 521 aa12.93□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa12.93□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa12.93□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 AADACP22760 399 aa12.93□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 FAM27BQ5VT28 67 aa12.93□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 FBXL14Q8N1E6 418 aa12.93□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 OR2C3Q8N628 320 aa12.93□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 ZIC4Q8N9L1 334 aa12.93□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 AKR7LQ8NHP1 331 aa12.93□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 IFNA17P01571 189 aa12.92□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 ATP6V0CP27449 155 aa12.92□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 PDCD1Q15116 288 aa12.92□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa12.92□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 OSR2Q8N2R0 312 aa12.92□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa12.92□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 PCED1AQ9H1Q7 454 aa12.92□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 SMDT1Q9H4I9 107 aa12.92□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 BCO1Q9HAY6 547 aa12.92□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 TINAGQ9UJW2 476 aa12.92□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 IGSF23A1L1A6 192 aa12.91□□□□□ -0.34
SYP-201ENST00000263233 NKX2-6A6NCS4 301 aa12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms