RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261667.7

KPNA3-201, Transcript of karyopherin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KPNA3, Length 4,474 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3-201ENST00000261667 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 ADCYAP1P18509 176 aa9.48□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 HOXA6P31267 233 aa9.48□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 LYRM7Q5U5X0 104 aa9.48□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 C19orf48Q6RUI8 117 aa9.48□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 SPPL3Q8TCT6 385 aa9.48□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 ZNF558Q96NG5 402 aa9.48□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 AQP10Q96PS8 301 aa9.48□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 VN1R3Q9BXE9 311 aa9.48□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 GPR62Q9BZJ7 368 aa9.48□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 TMEM106BQ9NUM4 274 aa9.48□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 SPCS1Q9Y6A9 102 aa9.48□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 PNLIPP16233 465 aa9.48□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 BCL6P41182 706 aa9.48□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 TCTAP57738 103 aa9.48□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 HIKESHIQ53FT3 197 aa9.48□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa9.48□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 CLDND1Q9NY35 253 aa9.48□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 CDC14CA4D256 554 aa9.47□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 PTGESO14684 152 aa9.47□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 FGF17O60258 216 aa9.47□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 SLC25A6P12236 298 aa9.47□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 DYNLT3P51808 116 aa9.47□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 SELENOTP62341 195 aa9.47□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 KIAA0040Q15053 153 aa9.47□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 SLC25A26Q70HW3 274 aa9.47□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 TAS1R1Q7RTX1 841 aa9.47□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa9.47□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 SMIM8Q96KF7 97 aa9.47□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 OR2A5Q96R48 311 aa9.47□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa9.47□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 A0A1W2PR80 420 aa9.47□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 SHISA3A0PJX4 238 aa9.47□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 M0QZQ0 153 aa9.47□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 TMEM97Q5BJF2 176 aa9.47□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 PLCXD3Q63HM9 321 aa9.47□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 CD300LDQ6UXZ3 194 aa9.47□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 MUCL1Q96DR8 90 aa9.47□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 PRDM13Q9H4Q3 707 aa9.47□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 CALHM2Q9HA72 323 aa9.47□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 MYO7AQ13402 2215 aa9.47□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 METTL12A8MUP2 240 aa9.47□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 HCRTR1O43613 425 aa9.47□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 PRNPP04156 253 aa9.47□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 DANCRP0C864 163 aa9.47□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 P2RY6Q15077 328 aa9.47□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 COX19Q49B96 90 aa9.47□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 SLC16A11Q8NCK7 471 aa9.47□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 OR10S1Q8NGN2 331 aa9.47□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 A0A087WWC5 75 aa9.46□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa9.46□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 GAGE12BA1L429 117 aa9.46□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 FGF16O43320 207 aa9.46□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 SLCO2B1O94956 709 aa9.46□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 CXCL1P09341 107 aa9.46□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 PXNP49023 591 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 SPINT3P49223 89 aa9.46□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 EMP1P54849 157 aa9.46□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 PFN3P60673 137 aa9.46□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 SLC25A30Q5SVS4 291 aa9.46□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 OTPQ5XKR4 325 aa9.46□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 SSX8Q7RTT4 187 aa9.46□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 NHLRC2Q8NBF2 726 aa9.46□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 TM4SF18Q96CE8 201 aa9.46□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 CTSEP14091 401 aa9.46□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 NPBWR2P48146 333 aa9.46□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP9.46□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 AGERQ15109 404 aa9.46□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 WFDC8Q8IUA0 241 aa9.46□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 OR2A1Q8NGT9 310 aa9.46□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 JKAMPQ9P055 326 aa9.46□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 OR51B4Q9Y5P0 310 aa9.46□□□□□ -0.89
KPNA3-201ENST00000261667 OR5B21A6NL26 309 aa9.46□□□□□ -0.9
KPNA3-201ENST00000261667 TMEM150CB9EJG8 249 aa9.46□□□□□ -0.9
KPNA3-201ENST00000261667 C11orf94C9JXX5 98 aa9.46□□□□□ -0.9
KPNA3-201ENST00000261667 FFAR1O14842 300 aa9.46□□□□□ -0.9
KPNA3-201ENST00000261667 LAG3P18627 525 aa9.46□□□□□ -0.9
KPNA3-201ENST00000261667 ZBTB25P24278 435 aa9.46□□□□□ -0.9
KPNA3-201ENST00000261667 MST1P26927 711 aa9.46□□□□□ -0.9
KPNA3-201ENST00000261667 ERVK-16P61578 105 aa9.46□□□□□ -0.9
KPNA3-201ENST00000261667 PLCXD2Q0VAA5 305 aa9.46□□□□□ -0.9
KPNA3-201ENST00000261667 FUT5Q11128 374 aa9.46□□□□□ -0.9
KPNA3-201ENST00000261667 Q1RN00 199 aa9.46□□□□□ -0.9
KPNA3-201ENST00000261667 VASH2Q86V25 355 aa9.46□□□□□ -0.9
KPNA3-201ENST00000261667 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa9.46□□□□□ -0.9
KPNA3-201ENST00000261667 SFRP2Q96HF1 295 aa9.46□□□□□ -0.9
KPNA3-201ENST00000261667 ZNF665Q9H7R5 613 aa9.46□□□□□ -0.9
KPNA3-201ENST00000261667 YIPF1Q9Y548 306 aa9.46□□□□□ -0.9
KPNA3-201ENST00000261667 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
KPNA3-201ENST00000261667 TRAV39A0A0B4J263 110 aa9.46□□□□□ -0.9
KPNA3-201ENST00000261667 A0A1B0GTH9 108 aa9.46□□□□□ -0.9
KPNA3-201ENST00000261667 MSGN1A6NI15 193 aa9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms