RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261507.10

MSMO1-201, Transcript of methylsterol monooxygenase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSMO1, Length 2,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMO1-201ENST00000261507 PDCD1Q15116 288 aa12.11□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 RAB35Q15286 201 aa12.11□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa12.11□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 AADACL3Q5VUY0 350 aa12.11□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 VWA1Q6PCB0 445 aa12.11□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 TFAP2EQ6VUC0 442 aa12.11□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 SSX8Q7RTT4 187 aa12.11□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 OR5H2Q8NGV7 314 aa12.11□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 DYRK2Q92630 601 aa12.11□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 FOXB1Q99853 325 aa12.11□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 WNT5BQ9H1J7 359 aa12.11□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 C12orf49Q9H741 205 aa12.11□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 SDHAF2Q9NX18 166 aa12.11□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 JKAMPQ9P055 326 aa12.11□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 KIF25Q9UIL4 384 aa12.11□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 TNFSF18Q9UNG2 199 aa12.11□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa12.1□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa12.1□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 C5orf51A6NDU8 294 aa12.1□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa12.1□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 ZNF587BE7ETH6 402 aa12.1□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 SHOXO15266 292 aa12.1□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 CST2P09228 141 aa12.1□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 UBBP0CG47 229 aa12.1□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 TGFBR3Q03167 851 aa12.1□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa12.1□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 SIGIRRQ6IA17 410 aa12.1□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 TMEM65Q6PI78 240 aa12.1□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 Q6ZT83 130 aa12.1□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 LRRC20Q8TCA0 184 aa12.1□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 PP6455Q8WZ26 134 aa12.1□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 LINC00052Q96N35 136 aa12.1□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 S100A13Q99584 98 aa12.1□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 FAAP24Q9BTP7 215 aa12.1□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 GPR35Q9HC97 309 aa12.1□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 A8MXE2 369 aa12.09□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 ALDH3B1P43353 468 aa12.09□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 ZNF92Q03936 586 aa12.09□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 TAF9Q16594 264 aa12.09□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 VAX1Q5SQQ9 334 aa12.09□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 TSPO2Q5TGU0 170 aa12.09□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 Q6ZSR3 168 aa12.09□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 EHFQ9NZC4 300 aa12.09□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 COMMD9Q9P000 198 aa12.09□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 OR6C6A6NF89 314 aa12.09□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 MFSD2BA6NFX1 497 aa12.09□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 DBX1A6NMT0 343 aa12.09□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 DHRS7CA6NNS2 312 aa12.09□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa12.09□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 CCL2P13500 99 aa12.09□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 ZMYND11Q15326 602 aa12.09□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 ANKRD55Q3KP44 614 aa12.09□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 DRAM2Q6UX65 266 aa12.09□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 CLEC18BQ6UXF7 455 aa12.09□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 SLC16A14Q7RTX9 510 aa12.09□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 ZNF610Q8N9Z0 462 aa12.09□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 OR1S1Q8NH92 325 aa12.09□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 ST8SIA2Q92186 375 aa12.09□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 OR2H1Q9GZK4 316 aa12.09□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 MBD2Q9UBB5 411 aa12.09□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.47
MSMO1-201ENST00000261507 KALRNO60229 2985 aa12.08□□□□□ -0.48
MSMO1-201ENST00000261507 A0A096LPE4 126 aa12.08□□□□□ -0.48
MSMO1-201ENST00000261507 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa12.08□□□□□ -0.48
MSMO1-201ENST00000261507 A0A1W2PPZ6 126 aa12.08□□□□□ -0.48
MSMO1-201ENST00000261507 FAM221AA4D161 298 aa12.08□□□□□ -0.48
MSMO1-201ENST00000261507 ZG16O60844 167 aa12.08□□□□□ -0.48
MSMO1-201ENST00000261507 IGKV1D-12P01611 117 aa12.08□□□□□ -0.48
MSMO1-201ENST00000261507 HLA-GP17693 338 aa12.08□□□□□ -0.48
MSMO1-201ENST00000261507 TBPP20226 339 aa12.08□□□□□ -0.48
MSMO1-201ENST00000261507 LUMP51884 338 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
MSMO1-201ENST00000261507 KCNRGQ8N5I3 272 aa12.08□□□□□ -0.48
MSMO1-201ENST00000261507 OR52H1Q8NGJ2 320 aa12.08□□□□□ -0.48
MSMO1-201ENST00000261507 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
MSMO1-201ENST00000261507 TM2D1Q9BX74 207 aa12.08□□□□□ -0.48
MSMO1-201ENST00000261507 CLEC18AA5D8T8 446 aa12.08□□□□□ -0.48
MSMO1-201ENST00000261507 SIGLEC5O15389 551 aa12.08□□□□□ -0.48
MSMO1-201ENST00000261507 CALCRP30988 508 aa12.08□□□□□ -0.48
MSMO1-201ENST00000261507 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa12.08□□□□□ -0.48
MSMO1-201ENST00000261507 TMEM128Q5BJH2 165 aa12.08□□□□□ -0.48
MSMO1-201ENST00000261507 SLC51BQ86UW2 128 aa12.08□□□□□ -0.48
MSMO1-201ENST00000261507 LHFPL1Q86WI0 220 aa12.08□□□□□ -0.48
MSMO1-201ENST00000261507 CLEC18CQ8NCF0 446 aa12.08□□□□□ -0.48
MSMO1-201ENST00000261507 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
MSMO1-201ENST00000261507 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
MSMO1-201ENST00000261507 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa12.08□□□□□ -0.48
MSMO1-201ENST00000261507 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
MSMO1-201ENST00000261507 H0YIZ8 118 aa12.07□□□□□ -0.48
MSMO1-201ENST00000261507 SERPINA5P05154 406 aa12.07□□□□□ -0.48
MSMO1-201ENST00000261507 SLC25A4P12235 298 aa12.07□□□□□ -0.48
MSMO1-201ENST00000261507 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
MSMO1-201ENST00000261507 FAM3AP98173 230 aa12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.7 ms