RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
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ODC1-201ENST00000234111 CLEC12BQ2HXU8 276 aa18.5■□□□□ 0.55
ODC1-201ENST00000234111 PRTGQ2VWP7 1150 aa18.5■□□□□ 0.55
ODC1-201ENST00000234111 ZNF774Q6NX45 483 aa18.5■□□□□ 0.55
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ODC1-201ENST00000234111 POLR1DQ9Y2S0 133 aa18.5■□□□□ 0.55
ODC1-201ENST00000234111 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
ODC1-201ENST00000234111 V9GYS6 101 aa18.5■□□□□ 0.55
ODC1-201ENST00000234111 NKX2-6A6NCS4 301 aa18.5■□□□□ 0.55
ODC1-201ENST00000234111 SCGB1D1O95968 90 aa18.5■□□□□ 0.55
ODC1-201ENST00000234111 ARL6IP1Q15041 203 aa18.5■□□□□ 0.55
ODC1-201ENST00000234111 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
ODC1-201ENST00000234111 ZNF665Q9H7R5 613 aa18.5■□□□□ 0.55
ODC1-201ENST00000234111 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
ODC1-201ENST00000234111 CHD9Q3L8U1 2897 aa18.5■□□□□ 0.55
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