RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638107.1

5S_rRNA.28-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 119 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 C11orf88Q6PI97 169 aa4.77□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 LIAT1Q6ZQX7 453 aa4.77□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 Q6ZS46 218 aa4.77□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 AMIGO2Q86SJ2 522 aa4.77□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CATSPERDQ86XM0 798 aa4.77□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TPRX1Q8N7U7 411 aa4.77□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 YIPF7Q8N8F6 280 aa4.77□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MALSU1Q96EH3 234 aa4.77□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CEP19Q96LK0 163 aa4.77□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CDCA4Q9BXL8 241 aa4.77□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PRRG3Q9BZD7 231 aa4.77□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa4.77□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MMP28Q9H239 520 aa4.77□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PLEKHA1Q9HB21 404 aa4.77□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP4.77□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SLC7A11Q9UPY5 501 aa4.77□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SNX5Q9Y5X3 404 aa4.77□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DSCAML1Q8TD84 2053 aa4.77□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 METTL15A6NJ78 407 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DHRS7CA6NNS2 312 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 VGLL3A8MV65 326 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SYT7O43581 403 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PSPNO60542 156 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FBXO24O75426 580 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 IGHA1P01876 353 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 KRT8P05787 483 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ZNF728P0DKX0 622 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CALCBP10092 127 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 BCL3P20749 454 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 KIR3DL2P43630 455 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NPBWR2P48146 333 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SNU13P55769 128 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ACTA2P62736 377 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 BLCAPP62952 87 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ACTG2P63267 376 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ACTC1P68032 377 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ACTA1P68133 377 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ZNF85Q03923 595 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ZNF91Q05481 1191 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TP53I3Q53FA7 332 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 OXLD1Q5BKU9 147 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SLC25A26Q70HW3 274 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GDPD3Q7L5L3 318 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GID4Q8IVV7 300 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 OR8H2Q8N162 312 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 Q8N2B8 174 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PRSS35Q8N3Z0 413 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 OR11H6Q8NGC7 330 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 OR52N4Q8NGI2 321 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 OR13D1Q8NGV5 346 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RPS4Y2Q8TD47 263 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 BCAS4Q8TDM0 211 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 EME1Q96AY2 570 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 BORCS8Q96FH0 119 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SNX22Q96L94 193 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ZNF714Q96N38 554 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 OR5M11Q96RB7 305 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CIB1Q99828 191 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PRSS22Q9GZN4 317 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CHST5Q9GZS9 411 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CHST6Q9GZX3 395 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ABCB10Q9NRK6 738 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 HILPDAQ9Y5L2 63 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PLXNB1O43157 2135 aa4.75□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MGAM2Q2M2H8 2515 aa4.75□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa4.75□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa4.75□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa4.75□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 hADV38S2A0JD32 116 aa4.75□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GATBO75879 557 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MMP23AO75900 390 aa4.75□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 HAND1O96004 215 aa4.75□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RBP4P02753 201 aa4.75□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 OR2T7P0C7T2 308 aa4.75□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PRKACAP17612 351 aa4.75□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GABRR1P24046 479 aa4.75□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CD24P25063 80 aa4.75□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FASP25445 335 aa4.75□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PEX2P28328 305 aa4.75□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DUSP1P28562 367 aa4.75□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 HTR1FP30939 366 aa4.75□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 POU3F4P49335 361 aa4.75□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RBP2P50120 134 aa4.75□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FUT6P51993 359 aa4.75□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ISL1P61371 349 aa4.75□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SLC34A1Q06495 639 aa4.75□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GRK1Q15835 563 aa4.75□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ATP6AP1Q15904 470 aa4.75□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TMEM95Q3KNT9 176 aa4.75□□□□□ -1.65
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FBLN7Q53RD9 439 aa4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms