RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	ERG	P11308	486 aa		4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	AQP1	P29972	269 aa		4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	SHMT2	P34897	504 aa		4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	TSPAN5	P62079	268 aa		4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	CDK6	Q00534	326 aa		4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	IL5RA	Q01344	420 aa		4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	RELA	Q04206	551 aa		4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	PRDX1	Q06830	199 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	CD47	Q08722	323 aa		4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	MADCAM1	Q13477	382 aa		4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	NEDD8	Q15843	81 aa		4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	LPAL2	Q16609	132 aa		4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	GALNT10	Q86SR1	603 aa		4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	HOGA1	Q86XE5	327 aa		4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	TBC1D19	Q8N5T2	526 aa		4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	TTL	Q8NG68	377 aa		4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	OR51F2	Q8NH61	342 aa		4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	LMX1A	Q8TE12	382 aa		4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	ISOC1	Q96CN7	298 aa		4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF75A	Q96N20	296 aa		4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	NODAL	Q96S42	347 aa		4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	APOL4	Q9BPW4	351 aa		4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	TM2D1	Q9BX74	207 aa		4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	MS4A8	Q9BY19	250 aa		4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	SCN3B	Q9NY72	215 aa		4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	MAT2B	Q9NZL9	334 aa		4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	DUX4	Q9UBX2	424 aa		4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		4	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		3.99	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM213	A2RRL7	107 aa		3.99	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	BUB3	O43684	328 aa		3.99	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	ACSM4	P0C7M7	580 aa		3.99	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	HTR1F	P30939	366 aa		3.99	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	CALCR	P30988	508 aa		3.99	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	RFC3	P40938	356 aa		3.99	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	TMBIM6	P55061	237 aa		3.99	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	GABARAPL2	P60520	117 aa		3.99	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	DSTN	P60981	165 aa		3.99	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	CXCR4	P61073	352 aa		3.99	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	UBE2K	P61086	200 aa		3.99	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	REEP5	Q00765	189 aa		3.99	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	GGTLC2	Q14390	218 aa		3.99	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		3.99	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		3.99	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	FAHD1	Q6P587	224 aa		3.99	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		3.99	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		3.99	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	EID2	Q8N6I1	236 aa		3.99	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	ACOT4	Q8N9L9	421 aa		3.99	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	OR2A1	Q8NGT9	310 aa		3.99	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		3.99	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		3.99	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	NEURL3	Q96EH8	262 aa		3.99	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	NRTN	Q99748	197 aa		3.99	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	BEX2	Q9BXY8	128 aa		3.99	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		3.99	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	WDR54	Q9H977	334 aa		3.99	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		3.99	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	VNN3	Q9NY84	501 aa		3.99	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	TAS2R7	Q9NYW3	318 aa		3.99	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		3.99	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		3.99	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	CEP250	Q9BV73	2442 aa		3.99	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	KNTC1	P50748	2209 aa		3.99	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		3.99	□□□□□ -1.77

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