RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	POLE4	Q9NR33	117 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM82	A0PJX8	343 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	CBFA2T2	O43439	604 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	MOS	P00540	346 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	IGLV2-11	P01706	119 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	LCAT	P04180	440 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	STMN1	P16949	149 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	PRDX2	P32119	198 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	KRTAP10-8	P60410	259 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	FUT5	Q11128	374 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	MADCAM1	Q13477	382 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	KCNMB1	Q16558	191 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	OGFOD2	Q6N063	350 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	OR1L1	Q8NH94	360 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	ASB10	Q8WXI3	467 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	THRSP	Q92748	146 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	SGK3	Q96BR1	496 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	CST11	Q9H112	138 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	PCTP	Q9UKL6	214 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	HSF4	Q9ULV5	492 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440		X6R8D5	127 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	KMT2D	O14686	5537 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	C15orf61	A6NNL5	157 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	SMTNL1	A8MU46	457 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	MT-ATP6	P00846	226 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	CTLA4	P16410	223 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	SDC1	P18827	310 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	CDK2	P24941	298 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	HMOX2	P30519	316 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	MAGEA3	P43357	314 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	MAP2K4	P45985	399 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	F2RL1	P55085	397 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	EDDM3A	Q14507	147 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	ACTBL2	Q562R1	376 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	AGBL2	Q5U5Z8	902 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	BTNL8	Q6UX41	500 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	RDH10	Q8IZV5	341 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	OR8B12	Q8NGG6	310 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	SNAPC3	Q92966	411 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	LGALS12	Q96DT0	336 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	OR8B4	Q96RC9	309 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	OR52E6	Q96RD3	313 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	MICU1	Q9BPX6	476 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	CENPM	Q9NSP4	180 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	MLX	Q9UH92	298 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	MUC17	Q685J3	4493 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	MFAP3L	O75121	409 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	HLA-DRB1	P01911	266 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	CRYGB	P07316	175 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	CBLN1	P23435	193 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	ACKR3	P25106	362 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	MAGEA6	P43360	314 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF92	Q03936	586 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	IMPG1	Q17R60	797 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	LIN52	Q52LA3	116 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SNAP23-223	ENST00000627440	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		4.19	□□□□□ -1.74

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