RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 CDK5R1Q15078 307 aa20.5■□□□□ 0.87
PMS1-220ENST00000618056 XAF1Q6GPH4 301 aa20.5■□□□□ 0.87
PMS1-220ENST00000618056 Q8IYB0 196 aa20.5■□□□□ 0.87
PMS1-220ENST00000618056 OR52N1Q8NH53 320 aa20.5■□□□□ 0.87
PMS1-220ENST00000618056 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PMS1-220ENST00000618056 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa20.5■□□□□ 0.87
PMS1-220ENST00000618056 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa20.5■□□□□ 0.87
PMS1-220ENST00000618056 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa20.5■□□□□ 0.87
PMS1-220ENST00000618056 F8VVB4 439 aa20.5■□□□□ 0.87
PMS1-220ENST00000618056 F8VWA3 439 aa20.5■□□□□ 0.87
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PMS1-220ENST00000618056 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa20.5■□□□□ 0.87
PMS1-220ENST00000618056 MKXQ8IYA7 352 aa20.5■□□□□ 0.87
PMS1-220ENST00000618056 CMTM4Q8IZR5 234 aa20.5■□□□□ 0.87
PMS1-220ENST00000618056 BATF2Q8N1L9 274 aa20.5■□□□□ 0.87
PMS1-220ENST00000618056 OR13C9Q8NGT0 318 aa20.5■□□□□ 0.87
PMS1-220ENST00000618056 FAM216AQ8WUB2 273 aa20.5■□□□□ 0.87
PMS1-220ENST00000618056 SLAMF9Q96A28 289 aa20.5■□□□□ 0.87
PMS1-220ENST00000618056 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
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PMS1-220ENST00000618056 ONECUT1Q9UBC0 465 aa20.5■□□□□ 0.87
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PMS1-220ENST00000618056 SERPINA12Q8IW75 414 aa20.49■□□□□ 0.87
PMS1-220ENST00000618056 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PMS1-220ENST00000618056 OR5D14Q8NGL3 314 aa20.49■□□□□ 0.87
PMS1-220ENST00000618056 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PMS1-220ENST00000618056 NEK6Q9HC98 313 aa20.49■□□□□ 0.87
PMS1-220ENST00000618056 CLEC2DQ9UHP7 191 aa20.49■□□□□ 0.87
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PMS1-220ENST00000618056 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PMS1-220ENST00000618056 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PMS1-220ENST00000618056 VMO1Q7Z5L0 202 aa20.48■□□□□ 0.87
PMS1-220ENST00000618056 ZNF485Q8NCK3 441 aa20.48■□□□□ 0.87
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PMS1-220ENST00000618056 ANKRD60Q9BZ19 345 aa20.48■□□□□ 0.87
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PMS1-220ENST00000618056 PRDM13Q9H4Q3 707 aa20.48■□□□□ 0.87
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PMS1-220ENST00000618056 OR14J1Q9UGF5 321 aa20.48■□□□□ 0.87
PMS1-220ENST00000618056 M0R1W7 72 aa20.47■□□□□ 0.87
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PMS1-220ENST00000618056 LHX4Q969G2 390 aa20.47■□□□□ 0.87
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PMS1-220ENST00000618056 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
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PMS1-220ENST00000618056 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
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PMS1-220ENST00000618056 SPACA5Q96QH8 159 aa20.44■□□□□ 0.86
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PMS1-220ENST00000618056 C19orf12Q9NSK7 152 aa20.44■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 CD2P06729 351 aa20.43■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 RPL31P62899 125 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 COL10A1Q03692 680 aa20.43■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 DEFB112Q30KQ8 113 aa20.43■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 RNF144BQ7Z419 303 aa20.43■□□□□ 0.86
PMS1-220ENST00000618056 SAXO1Q8IYX7 474 aa20.43■□□□□ 0.86
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