RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617087.1

PVT1-225, Transcript of Pvt1 oncogene, human

Gene PVT1, Length 130 nt, Biotype misc RNA, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PVT1-225	ENST00000617087	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	PLPP3	O14495	311 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	BET1	O15155	118 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	BRI3	O95415	125 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	HLA-DQB1	P01920	261 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	PRSS3	P35030	304 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	PFN3	P60673	137 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	STX4	Q12846	297 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	GAPT	Q8N292	157 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	OR5T1	Q8NG75	326 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	OR4M2	Q8NGB6	313 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	FRZB	Q92765	325 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	RNF5	Q99942	180 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	OPN4	Q9UHM6	478 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	CPS1	P31327	1500 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	IL1RN	P18510	177 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	PSMB2	P49721	201 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	OR2B6	P58173	313 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	UBE2K	P61086	200 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	TSPAN5	P62079	268 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	ANGPT1	Q15389	498 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	CLEC6A	Q6EIG7	209 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	OR2M7	Q8NG81	312 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	ESR2	Q92731	530 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	LINC00167	Q96N53	147 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	RILP	Q96NA2	401 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	SERPINB11	Q96P15	392 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	PIK3C2B	O00750	1634 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	IQGAP1	P46940	1657 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	ROCK1	Q13464	1354 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	SCN1A	P35498	2009 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	ADGRB3	O60242	1522 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	ARID1A	O14497	2285 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	PPP1CA	P62136	330 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	CDC20	Q12834	499 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	EBI3	Q14213	229 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	ZBTB6	Q15916	424 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	C5orf47	Q569G3	176 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	IDNK	Q5T6J7	187 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087		Q6ZT83	130 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	TMEM25	Q86YD3	366 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	SPACA5	Q96QH8	159 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	METTL26	Q96S19	204 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	CD300A	Q9UGN4	299 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	PRO0628	Q9UI54	55 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	TET3	O43151	1660 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	DYSF	O75923	2080 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	ZFYVE9	O95405	1425 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	NWD1	Q149M9	1564 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087		E9PCH4	1651 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	CENPBD1	B2RD01	187 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	UPK1A	O00322	258 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	TCAP	O15273	167 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	GIMD1	P0DJR0	217 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PVT1-225	ENST00000617087	MAGEA3	P43357	314 aa		3.34	□□□□□ -1.87

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