RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 A0A087WV62 115 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 PSMB5P28074 263 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 SLC6A12P48065 614 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 KLRB1Q12918 225 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 C1orf61Q13536 156 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 C19orf54Q5BKX5 351 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 CALHM1Q8IU99 346 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 PLPP6Q8IY26 295 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 PAAF1Q9BRP4 392 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 OR5V1Q9UGF6 321 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 PIGTQ969N2 578 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 SLAMF6Q96DU3 332 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 UFC1Q9Y3C8 167 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM262E9PQX1 116 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 M0R135 149 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 CTNSO60931 367 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 FGF5P12034 268 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 ID4P47928 161 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 ABHD17CQ6PCB6 329 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 DTD1Q8TEA8 209 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF799Q96GE5 643 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 LIPGQ9Y5X9 500 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 CDC14CA4D256 554 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 FITM1A5D6W6 292 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 MPDU1O75352 247 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 CA2P00918 260 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 PTGER1P34995 402 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 GAMTQ14353 236 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 DEGS2Q6QHC5 323 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM251Q8N6I4 163 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 TWSG1Q9GZX9 223 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 PTPRDP23468 1912 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 CXorf1O96002 111 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 CRYABP02511 175 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 SLC25A42Q86VD7 318 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 RPS4Y2Q8TD47 263 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 WNK2Q9Y3S1 2297 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 SMPD2O60906 423 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 SMUG1Q53HV7 270 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 FAM219AQ8IW50 185 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 ASB5Q8WWX0 329 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 PPT2Q9UMR5 302 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 PLPP1O14494 284 aa6.27□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 SLC25A20O43772 301 aa6.27□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 CD38P28907 300 aa6.27□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 PNLIPRP2P54317 469 aa6.27□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 LIM2P55344 173 aa6.27□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 PRTGQ2VWP7 1150 aa6.27□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF385BQ569K4 471 aa6.27□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 VHLLQ6RSH7 139 aa6.27□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 D2HGDHQ8N465 521 aa6.27□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa6.27□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 MRGPRX4Q96LA9 322 aa6.27□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 LAT2Q9GZY6 243 aa6.27□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 TXNIPQ9H3M7 391 aa6.27□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 BCL2L10Q9HD36 194 aa6.27□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 MIOXQ9UGB7 285 aa6.27□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 OR2J2O76002 312 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 COMPP49747 757 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 EDDM3AQ14507 147 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 HFEQ30201 348 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 WDR31Q8NA23 367 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 SPSB1Q96BD6 273 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 SARAFQ96BY9 339 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 CEP250Q9BV73 2442 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 PRSS37A4D1T9 235 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 PIAS2O75928 621 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 CLLU1OSQ5K130 101 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM81Q6P7N7 255 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM190Q8WZ59 177 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 Q96M85 177 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 OR2A5Q96R48 311 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 MGST2Q99735 147 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 GPR84Q9NQS5 396 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 PROCRQ9UNN8 238 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF737O75373 536 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-209ENST00000612229 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
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