RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547449.1

CS-209, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 434 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-209ENST00000547449 NKAPLQ5M9Q1 402 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 ATAD3CQ5T2N8 411 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 OR52W1Q6IF63 320 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 LINC00596Q86U02 117 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 TCTE3Q8IZS6 198 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 ARRDC1Q8N5I2 433 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 ZDHHC22Q8N966 263 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 BEST4Q8NFU0 473 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 OR10AD1Q8NGE0 317 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 OR13C8Q8NGS7 320 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 OR13G1Q8NGZ3 307 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 GIMAP1Q8WWP7 306 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 SULT4A1Q9BR01 284 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 CXXC4Q9H2H0 198 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 ING3Q9NXR8 418 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 AK3Q9UIJ7 227 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 POU2F3Q9UKI9 436 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 MEMO1Q9Y316 297 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 DOCK7Q96N67 2140 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 CEACAM18A8MTB9 384 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 F8VVB4 439 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 F8VWA3 439 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 PMP2P02689 132 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 SULT1A3P0DMM9 295 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 SULT1A4P0DMN0 295 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 VSIG10L2P0DP72 767 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 ZNF250P15622 560 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 PPP3CBP16298 524 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 AMY2BP19961 511 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 HRH1P35367 487 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 CA7P43166 264 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 FABP6P51161 128 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 SNU13P55769 128 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 TAS2R46P59540 309 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 ERVK11-1P61568 191 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 MZT1Q08AG7 82 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 CDK10Q15131 360 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 OR8G1Q15617 311 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP8.32□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 NKPD1Q17RQ9 610 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 WDR86Q86TI4 376 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 Q8IYB0 196 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 FAM58AQ8N1B3 248 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 SCCPDHQ8NBX0 429 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 OR5AP2Q8NGF4 316 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 OR5H2Q8NGV7 314 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 TERB2Q8NHR7 220 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 CCDC107Q8WV48 283 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 TLNRD1Q9H1K6 362 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 IFT22Q9H7X7 185 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 SPACA1Q9HBV2 294 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 CACNA1GO43497 2377 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 TMEM82A0PJX8 343 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 POM121CA8CG34 1229 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 H0YL77 283 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 IGHV3-13P01766 116 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 RLN1P04808 185 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 CD40P25942 277 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 OR3A3P47888 321 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 RPS23P62266 143 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 CBX3Q13185 183 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 MAB21L1Q13394 359 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 CHRFAM7AQ494W8 412 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 ZNF626Q68DY1 528 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 Q6ZS49 121 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 C22orf34Q6ZV56 151 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 OVCH2Q7RTZ1 564 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 TMEM17Q86X19 198 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 C11orf53Q8IXP5 236 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 SPICQ8N5J4 248 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 CYYR1Q96J86 154 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 SCGB3A2Q96PL1 93 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 HS3ST6Q96QI5 342 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 NRIP2Q9BQI9 281 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 BEX2Q9BXY8 128 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 PPA2Q9H2U2 334 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 BEX1Q9HBH7 125 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-209ENST00000547449 ZNF581Q9P0T4 197 aa8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.4 ms