RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540606.5

ATE1-208, Transcript of arginyltransferase 1, human

TSL 2 BASIC

Gene ATE1, Length 5,165 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATE1-208	ENST00000540606	FOXS1	O43638	330 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	11.73	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	TGIF1	Q15583	401 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	SSX1	Q16384	188 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	CRYBB2	P43320	205 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	GZMK	P49863	264 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	MEST	Q5EB52	335 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	PMS2CL	Q68D20	193 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	OCEL1	Q9H607	264 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	CREBBP	Q92793	2442 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	MSL2	Q9HCI7	577 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	CCL21	O00585	134 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	CTAG2	O75638	210 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	OR2J3	O76001	311 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	IGHA2	P01877	340 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	RASL12	Q9NYN1	266 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	CACNG5	Q9UF02	275 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	PPP1R1A	Q13522	171 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	XAF1	Q6GPH4	301 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	C10orf90	Q96M02	699 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	OR5B21	A6NL26	309 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	FFAR1	O14842	300 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	GP1BA	P07359	652 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	CELA2A	P08217	269 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	CYC1	P08574	325 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	C10orf111	Q8N326	155 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	ST8SIA2	Q92186	375 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	LAMA4	Q16363	1823 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	CCDC190	Q86UF4	302 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	DOK5	Q9P104	306 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	SCN7A	Q01118	1682 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	RFPL4A	A6NLU0	287 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	RFPL4AL1	F8VTS6	287 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	NKX2-8	O15522	239 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	SPN	P16150	400 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	DHRS2	Q13268	280 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	ASB10	Q8WXI3	467 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	NTM	Q9P121	344 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	FAM122A	Q96E09	287 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	SLC25A22	Q9H936	323 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	FBP1	P09467	338 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	FPR2	P25090	351 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	DEFA6	Q01524	100 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	FGF11	Q92914	225 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ATE1-208	ENST00000540606	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		11.71	□□□□□ -0.53

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